临床蛋白基因组学肿瘤分析财团-肺腺癌数据集

包含由CPTAC收集的肺腺癌患者的全面蛋白质组学、多组学数据,以及配套的数字病理学H&E切片和放射学CT影像。由National Cancer Institute提供,来自The Cancer Imaging Archive,包含多种数据模态,包含213条数据记录,适用于分类任务,许可证为CC BY 3.0,专注于肿瘤领域的肺癌研究。

National Cancer InstituteNational Cancer Institute
The Cancer Imaging Archive
2023-08-30 更新
浏览 7
多模态分类Lung Adenocarcinoma
CPTAC-LUAD

基本信息

模态
多模态
大小
732 GB
数据量
213
任务类型
分类
许可
CC BY 3.0
创建/更新时间
2023-08-30
版本
Ongoing

资源简介

临床蛋白基因组学肿瘤分析财团-肺腺癌数据集

【一句话概览】

本数据集是 TCIA 公开的多模态数据集,收录 合计 476.82 GB、244 例受试者,主题涵盖 Lung Adenocarcinoma,可用于跨模态对齐与融合建模研究,CC BY 4.0 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《The Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium Lung Adenocarcinoma Collection》。源站首次发布:2025/08/01。

【数据内容】

源站原始描述:All CPTAC cohorts are released as either a single combined cohort, or split into Discovery and Confirmatory where applicable. There are two main types of proteomic studies: discovery proteomics and targeted proteomics. The term "discovery proteomics" is in reference to "untargeted" identification and quantification of a maximal number of proteins in a biological or clinical sample. The term “targeted proteomics” refers to quantitative measurements on a defined subset of total proteins in a biolo…

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.7937/K9/TCIA.2018.PAT12TBS。

【主题与分类】

源站学科分类:CT、PT、MR、Histopathology。主题标签:Lung Adenocarcinoma。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cptac-luad/

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:National Cancer Institute Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC). (2018). The Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium Lung Adenocarcinoma Collection (CPTAC-LUAD) (Version 13) [dataset]. The Cancer Imaging Archive

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使用方式

数据集获取(TCIA 标准方式)

方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据集大小约 732.00 GB。

数据说明

包含由CPTAC收集的肺腺癌患者的全面蛋白质组学、多组学数据,以及配套的数字病理学H&E切片和放射学CT影像。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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