恩替诺特联合帕博利珠单抗治疗非小细胞肺癌的1b/2期开放标签剂量递增研究,并在非小细胞肺癌、黑色素瘤和错配修复正常结直肠癌患者中扩展队列

该数据集来自figshare,包含一份关于实体瘤分子谱分析的表格文件,涉及3164例实体瘤样本的靶向下一代测序检测结果。数据覆盖肺癌、结肠癌、黑色素瘤等实体瘤类型,记录了临床实验室在两年内对50个癌基因和抑癌基因中约2800个COSMIC突变位点的检测经验

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2023-07-06 更新
浏览 3
基因组分类solid tumorNGSlung cancercolon cancermelanoma
A Phase 1b/2, Open-label, Dose Escalation Study of Entinostat in Combination With Pembrolizumab in Patients With Non-small Cell Lung Cancer, With Expansion Cohorts in Patients With Non-small Cell Lung Cancer, Melanoma, and Mismatch Repair-Proficient Colorectal Cancer

基本信息

模态
基因组
大小
0.000056959 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-07-06
版本
v1

资源简介

恩替诺特联合帕博利珠单抗治疗非小细胞肺癌的1b/2期开放标签剂量递增研究,并在非小细胞肺癌、黑色素瘤和错配修复正常结直肠癌患者中扩展队列

Table_7_Molecular profiling of solid tumors by next-generation sequencing: an experience from a clinical laboratory.xlsx

该数据集来自figshare,包含一份关于实体瘤分子谱分析的表格文件,涉及3164例实体瘤样本的靶向下一代测序检测结果。数据覆盖肺癌、结肠癌、黑色素瘤等实体瘤类型,记录了临床实验室在两年内对50个癌基因和抑癌基因中约2800个COSMIC突变位点的检测经验。该数据可用于了解实体瘤中基因变异谱、评估NGS检测的诊断 yield,并支持肿瘤精准治疗相关的分子特征分析(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2023-07-06。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:个性化靶向治疗已改变多种实体瘤的管理。及时、准确地检测肿瘤中临床相关的遗传变异是实施分子靶向治疗的核心。为促进实体瘤的精准分子检测,靶向下一代测序(NGS)检测已成为一种有价值的工具。在本研究中,我们概述了在一家学术医疗机构为期两年的标准临床诊断评估中检测的3,164例实体瘤样本的技术验证、诊断 yield 和观察到的变异谱。方法:对靶向50个癌基因和抑癌基因中约2,800个COSMIC突变的Ion Ampliseq™ Cancer Hotspot Panel v2检测(ThermoFisher)进行了验证,并在两年内检测了总共3,164例肿瘤DNA样本。总共

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 56.96 KB。数据集 DOI:10.3389/fonc.2023.1208244.s007。

【主题与分类】

源站学科分类:Cancer、Haematological Tumours、Molecular Targets、Radiation Therapy、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Solid Tumours。主题标签:solid tumor、NGS、lung cancer、colon cancer、melanoma。本站分类:肿瘤/肺癌。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cancer、Haematological Tumours、Molecular Targets、Radiation Therapy、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Solid Tumours。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_7_Molecular_profiling_of_solid_tumors_by_next-generation_sequencing_an_experience_from_a_clinical_laboratory_xlsx/23633598

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Bhai, Pratibha; Turowec, Jacob; Santos, Stephanie; Kerkhof, Jennifer; Pickard, LeeAnne; Foroutan, Aidin; et al. (2023). Table_7_Molecular profiling of solid tumors by next-generation sequencing: an experience from a clinical laboratory.xlsx. Frontiers. Dataset

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数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_7_Molecular profiling of solid tumors by next-generation sequencing: an experience from a clinical laboratory.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/41469093"

文件清单

  • Table_7_Molecular profiling of solid tumors by next-generation sequencing: an experience from a clinical laboratory.xlsx(56.96 KB)

文件总体积 56.96 KB(源站 API 实测)。

数据说明

背景个性化靶向治疗已改变了多种实体瘤的管理模式。及时、准确地检测肿瘤中具有临床相关性的基因变异是实施分子靶向治疗的核心。为促进实体瘤的精准分子检测,靶向下一代测序(NGS)检测方法已成为一种有价值的工具。在本研究中,我们概述了在为期2年的时间内,某学术型医疗机构作为标准临床诊断评估的一部分所检测的3,164份实体瘤样本的技术验证、诊断阳性率及变异谱。方法对靶向50个癌基因和抑癌基因中约2,800个COSMIC突变的Ion Ampliseq™ Cancer Hotspot Panel v2检测(ThermoFisher)进行了验证,并在2年内共检测了3,164份肿瘤DNA样本。共有500份肿瘤样本采用包含全部50个基因的综合panel进行检测。其他样本,包括1,375例肺癌、692例结肠癌、462例黑色素瘤和135例脑癌,采用包含少数几个临床可操作基因的肿瘤特异性靶向亚panel进行检测。

结果在3,164份患者样本中,2,016份(63.7%)检测出至少一种临床相关变异呈阳性。在通过全面基因组检测组合检测的500份样本中,290份具有临床相关变异,其中TP53、KRAS和PIK3CA是最常见的突变基因。主要肿瘤类型的诊断率如下:乳腺癌(58.4%)、结直肠癌(77.6%)、肺癌(60.4%)、胰腺癌(84.6%)、子宫内膜癌(72.4%)、卵巢癌(57.1%)和甲状腺癌(73.9%)。肿瘤特异性靶向亚组检测组合也显示出高诊断率:肺癌(69%)、结肠癌(61.2%)、黑色素瘤(69.7%)和脑肿瘤(20.7%)。经常观察到多个基因突变的共存。结论我们的研究结果表明,将基于NGS的基因检测组合筛查整合为实体瘤评估标准诊断方案的一部分是可行的。高诊断率能够产生显著的临床影响,包括改善实体瘤患者的诊断、预后和临床管理。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fonc.2023.1208244.s007(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_7_Molecular_profiling_of_solid_tumors_by_next-generation_sequencing_an_experience_from_a_clinical_laboratory_xlsx/23633598)。

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