中国危重慢性疾病患者肠道菌群特征的多中心研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05638269

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：原发性高血压、肝癌、鼻咽癌、胰腺癌、肺癌、慢性肾脏病、急性冠脉综合征、癫痫。众多研究表明，微生物失调与多种人类疾病有关。然而，目前对于疾病相关微生物组特征的识别理解仍有限，这主要归因于由宿主塑造的微生物群落结构的异质性。无疑，微生物生物标志物的图谱需要在来自不同地区的大型、独立、基于人群的队列中进行验证。

基于这些，研究者计划组织一项多中心横断面队列研究，不仅系统性地描述多种关键慢性疾病的肠道微生物群特征，如肝癌、胃癌、胰腺癌、肺癌、鼻咽癌、高血压、急性冠脉综合征、原发性醛固酮增多症、癫痫、慢性肾脏病和亚临床甲状腺功能减退症，而且还旨在比较不同地区和不同疾病相关的微生物组特征的异同，并进一步探究它们对基于微生物群的诊断模型的影响。在本研究中，针对每种疾病，研究者期望招募500名确诊患者和500名性别及年龄匹配的对照组，记录其人口统计学、身体测量、生活方式、饮食、用药、疾病及生化相关信息，并收集其粪便、唾液、尿液和血液样本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。