PRJNA95523：端粒功能障碍

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA95523

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们使用微阵列分析了由急性端粒功能障碍所诱导的信号传导的普遍性（由TRF2DBDM表达诱导=数据集1），以及在TERC-与TERC+肝细胞癌（HCC）中的情况（数据集2）。关键词：急性端粒功能障碍，肝细胞癌。总体设计：展示的基因表达数据来自：数据集1：p53-/-小鼠静脉注射Ad TRF2DBDM与Ad GFP（2x10^10 PFU）48小时后的肝脏（GSM103546，GSM103547）；数据集2：来自mTERC+ HBs（GSM103548，GSM103549，GSM103553）与mTERC- HBs（GSM103550，GSM103551，GSM103552）转基因小鼠的p53-/-肝细胞癌（HCC）。所有小鼠均为C57BL/6J背景。数据集1：腺病毒感染后48小时提取肝脏RNA（每组n=3只小鼠），样品混合后在Affymetrix微阵列上进行杂交。数据集2：从12-15个月龄的mTERC+和mTERC-小鼠的HCC中提取RNA（每组n=3只小鼠）。单个肿瘤在Affymetrix微阵列上进行杂交。使用Array Assist 4.0（Stratagene）识别差异表达基因簇。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。