miR-424-5p通过激活PI3K/AKT信号通路在Hep3B细胞中发挥癌基因作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1403408

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数据说明

肝细胞癌（HCC）仍是全球性的健康挑战，具有高发病率和死亡率。微小RNA（miRNA）在癌症进展中发挥关键作用，但其在HBV相关HCC中的环境依赖性功能尚不清楚。本研究表明，miR-424-5p在HBV阳性Hep3B细胞中显著上调，并与患者不良预后相关。整合生物信息学分析预测，miR-424-5p的靶基因在PI3K/AKT信号通路中显著富集。功能实验显示，敲低miR-424-5p可抑制细胞增殖、迁移和集落形成。机制上，敲低miR-424-5p导致PTEN上调以及磷酸化PI3K/AKT下调，表明该通路受到抑制。这些发现揭示了miR-424-5p在HBV相关HCC中的致癌作用，提示其功能由病毒特异性失调的PI3K/AKT通路驱动，并涉及PTEN。我们的研究凸显了miR-424-5p作为潜在治疗靶点的价值，并为病因特异性miRNA调控网络提供了见解。

总体设计：该数据集支持正常与癌变人类肝细胞之间的比较转录组学研究，这对于理解肝细胞癌（HCC）发病机制至关重要。该项目共包含来自6个细胞系样本的RNA-seq数据，其中包括正常人肝细胞系L02的3个生物学重复和人肝细胞癌细胞系Hep3B的3个生物学重复。所有样本均在一致的基线条件下处理，如标准培养，并且该数据集提供了FASTQ文件中的原始测序数据以及处理后的基因表达矩阵，例如FPKM或TPM计数。该资源适用于识别差异表达基因和通路、探索致癌机制，以及在肝病模型、药物筛选或

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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