PRJNA1289747:糖尿病小鼠中酒精与高脂饮食导致的不同肝癌发生

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1289747),主题为糖尿病小鼠中酒精与高脂饮食导致的不同肝癌发生,属于肿瘤/肝癌分类,主题标签为转录组或基因表达

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1289747: Distinct Hepatocarcinogenesis Results From Alcohol and High Fat Diet in Diabetic Mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1289747:糖尿病小鼠中酒精与高脂饮食导致的不同肝癌发生

PRJNA1289747 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物研究项目记录,其完整英文名称为“Distinct Hepatocarcinogenesis Results From Alcohol and High Fat Diet in Diabetic Mice”,中文可译为“糖尿病小鼠中酒精与高脂饮食导致的不同肝癌发生”。该项目聚焦于糖尿病背景下酒精摄入与高脂饮食两种因素对肝癌发生过程的影响,属于肿瘤学中肝癌研究方向。项目在主题上被标注为转录组或基因表达,说明其产生的数据以基因表达层面的信息为主。该记录为研究者提供了一个统一入口,用以查找围绕这一研究计划所生成的各类生物数据,适合关注代谢因素与肝癌关系、以及相关转录组分析的研究人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集源自 NCBI BioProject(项目编号 1289747),研究主题为糖尿病小鼠中酒精与高脂饮食所导致的不同肝癌发生结果。从标题可以看出,研究关注两种饮食或暴露因素——酒精与高脂饮食——在糖尿病动物模型中诱发肝癌的差异表现。肝癌的发生机制复杂,代谢紊乱、饮食习惯等因素常被认为参与其中,而糖尿病作为常见的代谢性疾病,其与肝癌风险之间的关联是肿瘤研究关注的方向之一。该项目将糖尿病、酒精、高脂饮食与肝癌发生置于同一实验框架下,试图从基因表达层面刻画不同因素作用下肝癌发生的差异特征。项目在分类上归入肿瘤/肝癌方向,主题标签为转录组或基因表达,表明其数据产出以转录组学测量为核心。

【数据内容】

依据源站记录,该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,即转录组或基因表达。这表明项目所生成的数据主要涉及基因表达层面的测量结果,可能用于比较不同实验条件下基因表达谱的差异。BioProject 记录本身是围绕单一研究计划汇集各类生物数据的集合性条目,用户可通过该记录找到指向该项目所产生数据的链接。除主题标签所指示的转录组或基因表达数据外,源站未提供关于样本数量、测序平台、数据文件格式等更具体的内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库,源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是 NCBI 提供的生物项目登记系统,用于汇集来自单一组织或联盟、围绕同一研究计划产生的多种类型生物数据。每条 BioProject 记录为用户提供一个集中位置,以便查找该项目所生成的不同数据类型对应的链接。该项目编号为 1289747,其记录标题与英文名称一致,指向糖尿病小鼠中酒精与高脂饮食导致不同肝癌发生这一研究主题。关于样本采集的具体地点、时间、实验动物来源及处理细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤学特别是肝癌研究方向的分析工作,尤其是关注代谢因素与肝癌发生关系的转录组或基因表达研究。研究者可借助该项目的基因表达数据,探索酒精摄入与高脂饮食在糖尿病背景下对肝脏基因表达谱的不同影响,或将其作为比较不同肝癌发生模型的参考数据。对于从事糖尿病相关代谢紊乱与肿瘤发生机制研究的人员,该项目提供了以转录组为切入点的数据资源。此外,该记录也可用于生物信息学分析中的数据集检索与整合,帮助研究者定位与特定研究主题相关的公开数据。关于数据的具体适用范围与验证结论,源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问编号为 1289747 的项目记录,并经由该记录查找项目所关联的各类生物数据。BioProject 记录的作用在于提供统一入口,将同一研究计划下产生的不同数据类型链接汇集于一处,因此使用者应依据记录中给出的链接进一步获取所需的转录组或基因表达数据。关于数据下载的具体步骤、分析流程及配套工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 登记的项目记录,其数据质量与完整性取决于项目提交方所提供的信息。当前可确认的信息包括项目名称、研究主题、分类归属及主题标签,而样本规模、测序深度、数据覆盖度、质控指标等影响数据质量的关键参数,源站未提供。使用者在开展分析前应自行核查原始数据的具体情况。此外,该记录作为项目层面的条目,本身并不直接包含全部实验数据,需通过其链接获取实际数据文件。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号为 1289747。关于该项目的引用方式、数据使用许可及再分发条件,源站未提供。使用者在引用或使用相关数据时,应参照 NCBI 及项目提交方发布的相关规定。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1289747

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

酒精相关性肝病(ALD)与代谢相关脂肪性肝病(MASLD)具有相似的组织学特征,其肝脏病理变化涵盖脂肪变性、纤维化、肝硬化直至肝细胞癌(HCC)。本研究旨在确定这两类疾病在肝癌发生过程中是否具有共同机制。总体设计:通过分别喂食含5%乙醇的Lieber-DeCarli液体饲料5个月或高脂饲料4个月,在小鼠中构建酒精性脂肪性肝炎(ASH)或代谢相关脂肪性肝炎(MASH)模型。模型中联合出生后第2天给予链脲佐菌素所致的糖尿病前期,以诱发HCC发生。采用RNA测序比较乙醇或高脂饮食相关小鼠肿瘤与癌旁肝组织之间的转录组学变化。

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