棕榈酸处理HepG2细胞在姜黄素或姜黄素-铜复合物干预下的转录组测序

该数据集为BioProject(ID 1126246)收录的转录组测序数据,研究对象是经棕榈酸处理的HepG2细胞,并分别接受姜黄素或姜黄素-铜复合物干预

sra
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基因组回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA1126246: Transcriptome sequencing of palmitic acid-treated HepG2 cells upon intervention of curcumin or curcumin-copper complex

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

棕榈酸处理HepG2细胞在姜黄素或姜黄素-铜复合物干预下的转录组测序

PRJNA1126246 是一项收录于 NCBI BioProject 的转录组测序项目,全称为“Transcriptome sequencing of palmitic acid-treated HepG2 cells upon intervention of curcumin or curcumin-copper complex”。该项目以经棕榈酸处理的 HepG2 细胞为研究对象,并在此基础上分别施加姜黄素或姜黄素-铜复合物进行干预,通过转录组测序获取基因表达层面的数据。项目在 BioProject 中的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,本站将其归入肿瘤/肝癌分类。该数据集适合用于考察棕榈酸处理及姜黄素类干预对 HepG2 细胞转录组的影响,为相关体外细胞实验的基因表达分析提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库,项目编号为 PRJNA1126246。BioProject 是围绕某一项研究计划汇集生物数据的记录形式,这些数据来自单一机构或联合体;一条 BioProject 记录为用户提供统一入口,以便查找该项目所产生的多种类型数据。本项目聚焦于棕榈酸处理的 HepG2 细胞,并引入姜黄素或姜黄素-铜复合物作为干预条件,属于转录组或基因表达研究范畴。本站将其分类为肿瘤/肝癌方向。

【数据内容】

该数据集的内容为转录组测序数据,研究对象是经棕榈酸处理的 HepG2 细胞,并分别接受姜黄素或姜黄素-铜复合物干预。项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明数据围绕基因表达层面展开。除上述研究对象与干预条件外,源站未提供关于样本数量、测序平台、数据文件类型及具体分析结果的进一步说明。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,以 BioProject 记录形式发布,项目 ID 为 1126246。源站描述说明 BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合,来源于单一组织或联合体,并为用户提供查找该项目各类数据的统一入口。关于样本采集的具体流程、实验地点与时间等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于涉及 HepG2 细胞的转录组或基因表达研究,尤其是围绕棕榈酸处理以及姜黄素、姜黄素-铜复合物干预的体外细胞实验分析。其主题标签表明数据适用于基因表达层面的考察。关于更具体的适用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 NCBI BioProject 记录(ID 1126246)提供访问入口,用户可借助该记录查找项目所关联的各类数据。关于数据下载方式、文件格式及分析流程等具体使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、质控指标或使用限制的说明。该数据集为 BioProject 收录的转录组测序项目,其覆盖范围与完整性需以源站记录为准。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1126246

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

全球范围内,非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)对人类健康构成重大风险。天然多酚姜黄素(Cur)可在Cur-Cu复合物中作为铜(Cu)转运体,增强Cu的细胞负载,但该复合物对NAFLD的作用尚不清楚。本研究用棕榈酸(PA)处理HepG2肝癌细胞,建立体外NAFLD模型,旨在探究Cur-Cu复合物对该模型的影响,以及其减少HepG2细胞脂肪酸蓄积的潜在机制和靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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