人肝细胞癌(HCC)肿瘤活检的磷酸化蛋白质组学特征

主题标签:肿瘤、肝癌、磷酸化蛋白质组学、HCC、肿瘤活检。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。本数据集为肿瘤领域的时间序列公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖肿瘤。

google_dataset
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时间序列分类肿瘤肝癌磷酸化蛋白质组学HCC肿瘤活检
Phospho-proteomic characterization of human hepatocellular carcinoma (HCC) tumor biopsies

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

人肝细胞癌(HCC)肿瘤活检的磷酸化蛋白质组学特征

该数据集英文名为 Phospho-proteomic characterization of human hepatocellular carcinoma (HCC) tumor biopsies,聚焦人类肝细胞癌(HCC)肿瘤活检样本的磷酸化蛋白质组学表征,属于肿瘤领域中的肝癌方向公开数据集,来源为 ebi.ac.uk。数据集以肿瘤、肝癌、磷酸化蛋白质组学、HCC、肿瘤活检为核心主题标签,围绕肿瘤研究提供公开数据资源。从整体定位看,该数据集面向肝癌的基础与转化研究场景,通过磷酸化蛋白质组层面的刻画,为理解肝细胞癌肿瘤组织的分子特征提供数据基础,适合关注肿瘤信号通路与蛋白质修饰的研究者检索与使用。

【数据集背景】

肝细胞癌是肿瘤研究中的重要对象,针对肿瘤活检样本的分子层面表征有助于揭示肿瘤组织的蛋白质修饰状态。该数据集以人类肝细胞癌肿瘤活检样本为对象,开展磷酸化蛋白质组学表征,主题涵盖肿瘤领域,归属于肿瘤 / 肝癌分类。数据集的建立为肝癌相关研究提供了公开可获取的磷酸化蛋白质组数据资源,其背景定位与肿瘤分子表征的研究需求相一致。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括肿瘤、肝癌、磷酸化蛋白质组学、HCC、肿瘤活检,表明其内容围绕人类肝细胞癌活检样本的磷酸化蛋白质组展开。数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。关于具体样本数量、鉴定到的磷酸化位点数目、蛋白质与磷酸化肽段清单等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中记录其为 Eva Dazert(2021)发布的 Phospho-proteomic characterization of human hepatocellular carcinoma (HCC) tumor biopsies 数据集,访问地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD025836。关于样本采集的具体流程、活检组织处理方式、磷酸化肽段富集与质谱检测平台等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤特别是肝癌方向的磷酸化蛋白质组学研究,可用于围绕肝细胞癌肿瘤活检样本的分子特征开展检索、比较与分析,也可作为肿瘤蛋白质修饰相关研究的公开数据参考。关于具体的适用分析类型与方法学扩展,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档项目页面(PXD025836)公开提供。关于数据下载方式、文件组织格式、检索与复现分析的具体步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk。关于数据质量评估指标、样本代表性、技术重复与数据完整性等信息,源站未提供。

【引用与许可】

引用信息为:Eva Dazert (2021). Phospho-proteomic characterization of human hepatocellular carcinoma (HCC) tumor biopsies [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD025836。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Eva Dazert (2021). Phospho-proteomic characterization of human hepatocellular carcinoma (HCC) tumor biopsies [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD025836

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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