青莲饮干预MHCC97H肝癌细胞的DIA定量蛋白质组学数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.57760/sciencedb.j00231.0003f

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数据说明

本数据集为“青莲饮干预MHCC97H肝癌细胞的DIA-NN定量蛋白质组学数据集”，由延安大学附属医院研究团队构建。设置MHCC97H模型组与青莲饮干预组，每组3个生物学重复，共6个细胞样本。收集细胞沉淀进行总蛋白提取，经还原烷基化、胰酶酶切及MCX固相萃取脱盐后，在Vanquish Neo LC串联Thermo Orbitrap Astral质谱仪上采用Oscar-DIA模式进行质谱检测。使用DIA-NN 1.8.1软件对2024年审阅版人类UniProt数据库进行搜库定量，肽段和蛋白水平FDR≤1%。计算MD5校验值以确保数据完整性。本数据集包含6个原始DIA质谱文件、蛋白定量矩阵及MD5校验值列表，总大小约725 MB。

它支持生物信息学分析，包括差异蛋白筛选、亚细胞定位预测、GO/KEGG多数据库富集、GSEA、PPI蛋白-蛋白相互作用网络和WGCNA蛋白共表达网络。它可用于解析青莲饮处理后MHCC97H细胞的全局蛋白质组重编程，表征铁死亡、p53和PI3K-Akt等HCC相关通路的改变，并探索潜在靶点。该数据集为研究青莲饮的体外抗肝细胞癌机制提供了蛋白质组学资源。需要注意的是，这仅是体外蛋白质组学筛选；还需要进一步验证，包括Western-blot、PRM靶向质谱和细胞功能实验。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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