E2f1 招募 Pontin/Reptin 放大肝癌进程中 E2f 转录反应的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.31q7p

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 164.0 MB。

数据说明

肿瘤发生过程中基因表达的变化通常被认为是肿瘤内新发突变的结果。另一种可能性是，致癌转录因子的转录反应在肿瘤发生过程中发生演变。在此，我们展示，在肝癌小鼠模型中Rb基因家族失活后，异常的E2f活性最初激活了一个与细胞周期相关的强大基因表达程序。缓慢积累的E2f1逐步招募Pontin/Reptin复合体，以打开E2f靶基因处的染色质构象，并放大E2f转录反应。这一机制增强了E2f介导的细胞周期基因的反式激活，并启动了对低结合亲和力的E2f靶基因的激活，这些基因调控非细胞周期功能，如Warburg效应。这些数据表明，E2f的生理和致癌活性均导致不同的转录反应，这可用于靶向E2f致癌活性以进行治疗。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。