幼淋巴细胞白血病数据集

该数据集是一个专注于幼淋巴细胞白血病的肿瘤免疫计算数据集,主要包含通过单细胞TCR测序技术获取的TCR免疫组库序列数据以及构建的TCR-pHLA结合数据库,数据模态为基因序列和临床免疫数据。其主要用途是支持深度学习模型THLANet的开发与验证,用于预测T细胞受体与新抗原的结合特异性,从而为研究肿瘤免疫应答机制和推动个性化癌症免疫治疗提供关键的计算资源和实验依据。

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2025-09-12 更新
TCR-新抗原结合预测肿瘤免疫计算
创建时间2025-09-12
更新时间2025-09-12
原始链接

https://figshare.com/articles/dataset/Prolymphocytic_leukemia_dataset_/30117277

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资源简介

该数据集来源于幼淋巴细胞白血病(PLL)相关研究,聚焦于肿瘤免疫学中的T细胞受体(TCR)与新抗原的结合预测。数据集包含了通过单细胞TCR测序(scTCR-seq)技术获取的TCR免疫组库数据,并构建了TCR-pHLA结合数据库,用于验证深度学习模型THLANet的临床潜力。THLANet模型采用进化尺度建模-2(ESM-2)来增强序列特征表示,仅使用TCR序列(CDR3β)、抗原序列和I类HLA信息,即可预测TCR与由HLA呈递的新抗原之间的结合特异性。该数据集支持对TCR-抗原三维结合相互作用的深入分析,并为评估新抗原的免疫原性潜力、推动个性化癌症免疫治疗研究提供关键数据资源。

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