通过断裂点序列识别实现CRISPR-Cas13b对致癌融合转录本的可编程选择性沉默

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数据说明

致癌性基因融合是癌症的关键驱动因素，但目前大多数仍无法被现有疗法靶向。在此，我们建立了CRISPR-PspCas13b作为一种可个性化定制的平台，用于系统性沉默多种融合转录本。我们发现，PspCas13b对断点序列的识别和切割会破坏融合转录本，导致切割位点附近出现意外的RNA切口和连接，从而产生移码、无翻译能力的转录本。重要的是，我们证明靶向BCR::ABL1断点序列可有效降解典型及耐药型BCR::ABL1突变体，而这些突变体是慢性髓性白血病（CML）中酪氨酸激酶抑制剂（TKI）耐药和复发的主要驱动因素。分子谱分析显示，PspCas13b引发广泛的转录组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组重塑，最终导致对临床药物完全耐药的CML细胞发生红系分化和凋亡。

超越BCR-…，通过CRISPR-Cas13b识别断点序列实现对致癌融合转录本的可编程和选择性沉默在Dryad上访问此数据集 此数据集包含相关手稿正文及补充图表所依据的数值源数据和未裁剪的Western blot图像。本研究探讨了使用PspCas13b向导RNA（crRNAs）识别融合转录本断点序列，选择性破坏致癌融合RNA，减少融合蛋白表达，抑制下游致癌信号传导，并改变融合依赖性癌细胞的存活与分化。该工作簿还包含短读长RNA测序、Oxford Nanopore直接RNA测序、质谱蛋白质组学、流式细胞术、RT-qPCR、报告基因检测和细胞增殖数据。 ## 数据与文件结构说明 ### 包含的文件 * source_file_v3.xlsx：包含75个工作表的Excel工作簿。每

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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