PRJNA994327：维生素K1诱导急性T细胞淋巴细胞白血病Jurkat细胞毒性效应及转录组分析
该数据集来自NCBI，聚焦维生素K1对急性T细胞淋巴细胞白血病Jurkat细胞的细胞毒性效应及基因表达变化。研究通过Illumina Novaseq6000测序仪进行RNA测序，分析维生素K1诱导的差异表达基因
基本信息
资源简介
PRJNA994327：维生素K1诱导急性T细胞淋巴细胞白血病Jurkat细胞毒性效应及转录组分析
PRJNA994327 数据集聚焦维生素 K1（VK1）对急性 T 细胞淋巴细胞白血病 Jurkat 细胞（Jurkat T 细胞）的细胞毒性效应及其引发的基因表达变化。维生素 K1 作为一种与凝血相关的必需营养素，已被证明在多种癌细胞中具有抗癌特性，但其对血液系统恶性肿瘤的影响尚不清楚。该研究旨在评估 VK1 对 Jurkat T 细胞的细胞毒性作用，并观察 VK1 诱导的 Jurkat T 细胞基因表达改变。研究采用 Illumina Novaseq6000 测序仪进行 RNA 测序，分析 VK1 诱导的差异表达基因（DEGs）。数据集归类于肿瘤/白血病方向，主题标签为转录组或基因表达，来源于 NCBI。
【数据集背景】
维生素 K1 是一种与凝血功能密切相关的必需营养素，已有研究证明其在多种癌细胞中具有抗癌特性。然而，VK1 对血液系统恶性肿瘤的作用了解甚少。急性 T 细胞淋巴细胞白血病是血液系统恶性肿瘤的一种，Jurkat 细胞是研究该疾病的常用细胞模型。该研究正是针对这一空白，评估 VK1 对 Jurkat T 细胞的细胞毒性效应，并进一步观察 VK1 诱导的基因表达变化，以期为理解 VK1 在血液系统恶性肿瘤中的作用提供转录组层面的依据。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 VK1 诱导的 Jurkat T 细胞差异表达基因（DEGs）分析结果。研究通过 RNA 测序获得转录组数据，并据此识别在 VK1 处理条件下表达发生变化的基因。数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据主体属于转录组或基因表达范畴。除差异表达基因分析这一核心内容外，源站未提供关于数据文件具体组成、样本数量、分组设计细节或数据规模的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），英文名称为“PRJNA994327: Vitamin K1 induced cytotoxic effects and transcriptomic analysis in acute T-cell lymphocytic leukemia Jurkat cells”。研究以急性 T 细胞淋巴细胞白血病 Jurkat 细胞（Jurkat T 细胞）为对象，采用 Illumina Novaseq6000 测序仪进行 RNA 测序，以获得 VK1 诱导后的基因表达信息。整体设计为通过 RNA 测序分析 VK1 诱导的 Jurkat T 细胞差异表达基因。关于样本采集时间、处理浓度、重复设置等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组与基因表达研究，特别是围绕维生素 K1 对血液系统恶性肿瘤细胞作用的分析场景。具体而言，可用于研究 VK1 对急性 T 细胞淋巴细胞白血病 Jurkat 细胞的细胞毒性效应及其转录组响应，支持差异表达基因的识别与后续功能分析。也可作为肿瘤/白血病方向中关于营养素或化合物诱导基因表达变化研究的参考数据。由于源站未提供更详细的设计信息，其他具体应用场景需结合原始数据自行判断。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI 来源站获取，英文名称中的 PRJNA994327 为其在 NCBI 上的项目标识。使用者可依据该标识在 NCBI 检索并下载相关数据，用于差异表达基因分析或转录组层面的再分析。由于源站未提供数据处理流程、标准化方法或分析参数等说明，具体使用方式需参考原始项目页面及相关记录。
【质量与限制】
该数据集基于 Illumina Novaseq6000 测序仪产生的 RNA 测序数据，围绕 VK1 诱导的 Jurkat T 细胞差异表达基因展开。其局限在于：源站未提供样本量、重复数、测序深度、数据质控指标等信息，无法据此评估数据的具体质量水平；同时，研究仅涉及 Jurkat 细胞这一细胞模型，结果的外推范围需谨慎对待。关于数据质量的其他细节，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI，英文名称为“PRJNA994327: Vitamin K1 induced cytotoxic effects and transcriptomic analysis in acute T-cell lymphocytic leukemia Jurkat cells”。关于引用方式与许可条款，源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA994327
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
维生素K1（VK1）是一种与凝血相关的必需营养素，已被证明在多种癌细胞中具有抗癌特性。然而，关于VK1对血液系统恶性肿瘤的影响知之甚少。本研究旨在评估VK1对急性T细胞淋巴细胞白血病Jurkat细胞（Jurkat T细胞）的细胞毒性作用。此外，还观察了VK1诱导的Jurkat T细胞基因表达变化。总体设计：通过Illumina Novaseq6000测序仪进行RNA测序，分析VK1诱导的Jurkat T细胞差异表达基因（DEGs）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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