PRJNA99367：小白菊内酯处理原代急性髓系白血病标本
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，属于肿瘤/白血病分类，主题为转录组或基因表达。源站描述显示，研究评估了 7.5 微摩尔小白菊内酯（PTL）对来自 12 例患者的原代 CD34+ 急性髓系白血病标本的影响
基本信息
资源简介
PRJNA99367：小白菊内酯处理原代急性髓系白血病标本
PRJNA99367 数据集聚焦于原代急性髓系白血病（AML）标本在小白菊内酯（parthenolide，PTL）处理下的转录组响应。该数据集收录于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），在本站归入肿瘤/白血病分类，主题标签为转录组或基因表达。根据源站描述，研究从 12 例患者获取原代 CD34+ 急性髓系白血病标本，在体外培养条件下分别以 7.5 微摩尔小白菊内酯处理或保持未处理状态，处理持续 6 小时，随后提取总 RNA 用于全基因组基因表达分析。该数据集的核心价值在于以患者来源的原代白血病细胞为对象，记录药物暴露后基因表达层面的变化，为理解小白菊内酯对急性髓系白血病细胞转录程序的影响提供数据基础。
【数据集背景】
急性髓系白血病是一种起源于髓系造血干/祖细胞的恶性血液肿瘤，CD34+ 细胞群体常被用作研究白血病干/祖细胞生物学特性及药物反应的重要材料。小白菊内酯是一种来源于植物的倍半萜内酯类化合物，在肿瘤药理学研究中受到关注。该数据集围绕原代 CD34+ 急性髓系白血病标本对小白菊内酯的体外响应展开，采用药物处理与未处理对照比较的实验设计，旨在从全基因组表达层面刻画药物暴露后的转录组变化。源站描述将关键词概括为药物反应与基因表达，说明该研究的关注点在于药物作用下的表达谱改变，而非单纯的标本基线特征描述。
【数据内容】
数据集的主题标签为转录组或基因表达，源站描述表明其数据来自全基因组基因表达分析。实验涉及 12 例患者的原代 CD34+ 急性髓系白血病标本，每例标本均设置小白菊内酯处理组与未处理组，处理浓度为 7.5 微摩尔，处理时间为 6 小时，之后收获总 RNA 用于表达谱检测。源站未提供具体的基因数量、检测平台型号、样本总数、数据文件格式与文件大小等细节。数据内容的核心比较关系是同一患者标本在药物处理与未处理状态之间的基因表达差异，这种配对设计有助于在患者个体层面观察药物引起的表达变化。
【采集与来源】
标本来源于 12 例急性髓系白血病患者，经分离获得 CD34+ 细胞。细胞在体外培养体系中接受处理：一组暴露于 7.5 微摩尔小白菊内酯，另一组不作处理，处理时长均为 6 小时。随后从细胞中提取总 RNA，用于全基因组基因表达分析。数据通过 NCBI 站点发布，本站将其归入肿瘤/白血病分类。源站未提供患者的具体临床信息、标本采集地点、伦理审批信息以及 RNA 提取与检测的具体实验方案细节。
【适用场景】
该数据集适用于研究小白菊内酯对原代急性髓系白血病 CD34+ 细胞转录组的影响，可用于探索药物暴露 6 小时后基因表达谱的变化模式，比较处理组与未处理组之间的表达差异，并可在患者来源标本层面考察不同样本对同一药物处理的表达响应。由于数据主题为转录组或基因表达，其典型用途包括差异表达分析、药物反应相关基因表达模式观察以及与其他白血病转录组数据集的比较研究。源站未提供该数据集在具体疾病分型、疗效预测或临床转化方面的应用结论。
【使用方法】
使用该数据集时，可依据源站描述中的分组信息，将同一患者的处理组与未处理组样本进行配对比较，以识别与小白菊内酯暴露相关的表达变化。分析前应确认样本与分组对应关系，并按照转录组数据处理的常规流程进行表达定量、标准化与差异分析。由于源站未提供检测平台、数据格式与预处理细节，具体分析步骤需结合数据文件的实际内容确定。源站未提供推荐的分析软件、参数设置或标准化流程。
【质量与限制】
该数据集的样本量来自 12 例患者，每例设置处理与未处理对照，处理条件统一为 7.5 微摩尔小白菊内酯、6 小时，实验设计较为明确。但源站未提供测序深度、重复次数、数据质控指标、批次信息以及患者临床特征等关键细节，因此无法据此评估数据的技术质量与生物学代表性。此外，体外处理 6 小时的表达谱仅反映该时间点与该浓度下的转录组状态，不能直接外推至其他浓度、其他时间点或体内情形。源站未提供关于数据局限性或验证实验的说明。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，源站未提供具体的引用文献、作者列表、发表期刊以及数据使用许可条款。使用或再分发该数据集前，应访问源站页面查阅其最新的引用要求与使用政策。源站未提供许可类型与数据共享限制的明确说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA99367
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
评估了7.5微摩尔小白菊内酯（PTL）对取自12例患者的原代CD34+急性髓系白血病标本的影响。关键词：药物反应，基因表达搜索工具。总体设计：从12例患者获取急性髓系白血病（AML）标本并分离CD34+细胞。对每例患者，细胞在体外培养，并暴露于7.5微摩尔小白菊内酯（PTL）或保持未处理（UT）状态6小时。随后提取总RNA用于全基因组基因表达分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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