PRJNA942259:AML 发展中核线粒体呼吸蛋白选择性翻译重编程琥珀酸代谢及化疗耐药 [RNA-seq]

该数据集来自 NCBI BioProject(编号 PRJNA942259),主题为急性髓系白血病(AML)发展中核线粒体呼吸蛋白的选择性翻译如何重编程琥珀酸代谢并影响化疗耐药,数据类型为 RNA-seq,属于转录组或基因表达范畴

sra
浏览 13
基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA942259: Selective translation of nuclear mitochondrial respiratory proteins reprograms succinate metabolism in AML development and chemoresistance. [RNA-seq]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA942259:AML 发展中核线粒体呼吸蛋白选择性翻译重编程琥珀酸代谢及化疗耐药 [RNA-seq]

PRJNA942259 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的 RNA-seq 数据集,其研究主题聚焦于急性髓系白血病(AML)发展过程中,核线粒体呼吸蛋白的选择性翻译如何重编程琥珀酸代谢,并进一步影响化疗耐药。该数据集属于肿瘤/白血病分类,数据类型为 RNA-seq,主题标签为转录组或基因表达。作为 BioProject 体系下的一项记录,它为使用者提供了一个集中入口,用以查找与该研究计划相关的多种数据类型和链接。整体而言,该数据集围绕 AML 的分子机制展开,尤其关注线粒体呼吸蛋白翻译调控与代谢重编程之间的关联,适合对白血病转录组、代谢与耐药机制感兴趣的研究人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集对应的研究计划旨在探究急性髓系白血病(AML)发生发展及化疗耐药过程中的分子机制。其核心关注点是核线粒体呼吸蛋白的选择性翻译,以及这一过程如何重编程琥珀酸代谢。AML 是一种影响血液和骨髓的恶性肿瘤,化疗耐药是临床治疗中的主要挑战之一。该研究将线粒体呼吸蛋白的翻译调控与琥珀酸代谢联系起来,试图从转录组层面揭示其在 AML 发展和耐药形成中的作用。数据集来源于 NCBI BioProject,编号为 PRJNA942259,属于肿瘤/白血病领域,主题标签为转录组或基因表达。

【数据内容】

该数据集的数据类型为 RNA-seq,属于转录组或基因表达范畴。其主题标签明确指向“Transcriptome or Gene expression”,表明数据内容主要涉及基因表达层面的信息。研究主题涉及核线粒体呼吸蛋白的选择性翻译、琥珀酸代谢重编程以及 AML 化疗耐药。RNA-seq 技术通常用于检测样本中基因的表达水平,因此该数据集可用于分析相关基因在 AML 发展及耐药过程中的表达变化。关于样本数量、测序平台、读长、覆盖度等具体技术参数,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 NCBI BioProject,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,编号为 PRJNA942259。BioProject 是 NCBI 提供的一项资源,用于汇集与某一研究计划相关的生物学数据,这些数据可来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供了一个统一的位置,以便查找该项目产生的多种数据类型及其链接。该数据集的源站标题为“Selective translation of nuclear mitochondrial res... (ID 942259) - BioProject - NCBI”,英文名称为“PRJNA942259: Selective translation of nuclear mitochondrial respiratory proteins reprograms succinate metabolism in AML development and chemoresistance. [RNA-seq]”。关于具体样本采集地点、时间、伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于转录组或基因表达相关研究,尤其是与急性髓系白血病(AML)相关的分析。具体而言,可用于探索核线粒体呼吸蛋白选择性翻译、琥珀酸代谢重编程以及化疗耐药机制等方向。由于数据类型为 RNA-seq,适合进行基因表达差异分析、转录本水平研究以及相关通路的功能注释。对于关注肿瘤代谢、线粒体功能与白血病耐药的研究人员,该数据集可作为转录组层面的参考资源。此外,该数据集也可用于方法学比较或作为公共数据资源进行整合分析。关于具体的适用分析流程或推荐工具,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问,编号为 PRJNA942259。用户可在 BioProject 记录页面查找与该研究计划相关的数据链接和多种数据类型。由于该记录属于 BioProject 体系,其设计目的是提供单一入口以定位项目产生的数据。具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或软件推荐,源站未提供。使用者可根据 RNA-seq 数据的通用处理方式,结合自身研究需求进行后续分析。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共数据库记录。其主题标签为转录组或基因表达,数据类型为 RNA-seq。关于数据质量指标,如测序深度、碱基质量、比对率、重复性等,源站未提供。关于样本量、生物学重复、批次效应等信息,源站未提供。此外,该数据集的具体研究结论、统计显著性及验证实验结果,源站未提供。使用者在使用时应注意结合原始文献或项目页面获取更详细的质量评估信息。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject,编号为 PRJNA942259。关于具体的引用方式、许可协议或使用条款,源站未提供。建议用户在使用该数据集时,参考 NCBI BioProject 的通用引用规范,并查阅项目页面以获取可能的授权信息。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA942259

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们在此鉴定出一种新型RAS响应元件结合蛋白1短异构体RREB1α,其在调控线粒体复合体II翻译以促进急性髓系白血病癌症干细胞的干性和耐药性中起关键作用。总体设计:[RNA-seq] 本数据集包含从WT或Rreb1-KO小鼠中分离的白血病干细胞的RNA-seq实验。从骨髓中分离白血病干细胞进行RNAseq分析,包含两个生物学重复。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案