PRJNA93875：MLL-AF9通过激活干细胞程序将定向祖细胞转化为白血病干细胞（实验1）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA93875

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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

白血病及其他癌症中存在一小群具有自我更新能力的稀有细胞，根除这些癌症干细胞很可能是实现长期无癌生存的必要条件。鉴于正常干细胞和癌症干细胞均具备自我更新能力，若要开发靶向治疗，癌症干细胞与正常组织干细胞之间的相似程度便成为一个关键问题。我们将人类急性髓系白血病（AML）中由t(9;11)(p22;q23)编码的MLL-AF9融合蛋白导入小鼠定向粒-巨噬祖细胞（GMP）中。所得白血病所含细胞的免疫表型与正常GMP相似，且高度富集白血病干细胞（LSC）。对正常造血干细胞（HSC）、定向祖细胞及LSC群体进行详细的基因表达比较显示，LSC整体上比任何其他群体都更接近正常GMP。然而，一组在正常干细胞中高表达的基因在LSC中被重新激活。

这些数据表明，白血病干细胞（LSC）可由定向祖细胞产生，而无需广泛的基因表达重编程，并且在此过程中激活了与白血病自我更新相关的特征性表达谱。我们的发现定义了从正常造血祖细胞向白血病干细胞的演变过程，并提示靶向在异常背景下表达的自我更新程序可能是可行的。关键词：MLL、干细胞、白血病干细胞 总体设计：分离的粒细胞-巨噬细胞祖细胞与表达GFP或MLL-AF9及GFP的逆转录病毒共孵育。40小时后，分离GFP阳性细胞，并将RNA杂交至Affymetrix微阵列。实验重复三次。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。