PRJNA918658：DOT1L调控NK细胞成熟与谱系完整性 RNA-seq D5

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA918658

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数据说明

在先天免疫系统中，自然杀伤（NK）细胞是一个极为重要的细胞亚群，在控制转化细胞和肿瘤炎症方面具有至关重要的作用。既往研究表明，NK细胞在富含TGF-β的肿瘤微环境（TME）中可转化为ILC1样细胞。此外，急性髓系白血病（AML）或慢性淋巴细胞白血病（CLL）的癌症患者外周血单个核细胞（PBMCs）中ILC1细胞频率增加，这些细胞不仅促炎细胞因子IFN-γ和TNF的产生减少，颗粒酶B的产生也降低。在本研究中，我们鉴定出组蛋白甲基转移酶DOT1L是体外和体内NK细胞谱系完整性的关键调控因子。来自NKp46条件性DOT1L敲除小鼠（DOT1L.Ncr1）的NK细胞显示ILC1样细胞（CD49b+ CD49a+）频率增加，并且ILC1标志物CD200R、TRAIL的表达增多，而Ly49H的表达降低。我们进一步发现，ILC1样表型的增加在很大程度上不依赖于TGFβ。

对缺乏DOT1L时转录因子（TF）可用性的评估显示，在DOT1L缺失的情况下，心肌细胞特异性增强因子（MEF）2C是下调最显著的转录因子。通过CRISPR-Cas9介导的MEF2C缺失，最终提供了证据表明该转录因子在体内限制了NK细胞的可塑性。我们的发现揭示了DOT1L和MEF2C在NK细胞生物学中维持NK细胞谱系完整性的先前未知作用，并可能最终为白血病或其他依赖NK细胞谱系的恶性肿瘤患者带来更有效的治疗手段。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。