PRJNA875418：环状RNA研究展望——MLL重组组视角

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA875418

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症基因组中的染色体易位是重要的致癌驱动因素。在MLL重排的急性白血病（MLLre）中，MLL/KMT2A与超过90个伙伴基因发生融合。机制研究为MLL融合蛋白的白血病生成潜能提供了线索，但模型未能完全重现该疾病。近期，MLL-AF9融合表达致癌性融合环状RNA（f-circ）已被证实。这一发现，连同关于circRNA重要性和多样性的新兴数据，构成了研究MLL重组体circRNA的动因。通过与其他RNA（如microRNA）及蛋白质的相互作用，circRNA调控与癌症发展相关的细胞过程。CircRNA也可翻译为功能性肽。MLL及90个MLL易位伙伴中的大多数确实表达circRNA，而对我们分选血细胞群体RNA-seq数据集的探索，为MLL重组体circRNA的可变环状异构体生成及表达变异性提供了新数据。

此外，我们提供了证据表明MLL的重排及其三个主要易位伴侣基因可影响circRNA表达，白血病细胞中的初步观察也支持这一结论。这一 emerging 图景支持了在研究MLL重排白血病时circRNAs值得考虑的观点，并为染色体易位对癌细胞整体影响提供了新视角。总体设计：对携带MLL::ENL（KMT2A::MLLT1）重排的患者来源异种移植（PDX）的RNA-seq数据进行circRNA表达谱分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。