DISCOVeRY-BMT 共享移植物抗白血病次要组织相容性抗原数据集
该数据集来自 NCBI，属于肿瘤/白血病分类，主题为转录组或基因表达。其目的是基于 DISCOVeRY-BMT 数据集预测共享的移植物抗白血病次要组织相容性抗原（mHAs），并通过质谱在具有相应 HLA 等位基因且 mHA 源基因有非零 RNAseq 读数的细胞系中验证预测的 mHAs
基本信息
资源简介
DISCOVeRY-BMT 共享移植物抗白血病次要组织相容性抗原数据集
PRJNA873278 是一个来自 NCBI 的转录组或基因表达主题数据集，归入肿瘤/白血病分类，全称为 Shared Graft Versus Leukemia Minor Histocompatibility Antigens in DISCOVeRY-BMT。该数据集的核心目标是从 DISCOVeRY-BMT 数据集中预测共享的移植物抗白血病次要组织相容性抗原（mHAs），并进一步通过质谱手段，在具有相应 HLA 等位基因、且 mHA 源基因对应非零 RNAseq 读数的细胞系中对预测结果进行验证。整体设计围绕五种急性髓系白血病（AML）细胞系的 RNAseq 读段计数分析展开，这五种细胞系分别为 Nomo1、Monomac1、NB4、OCI-AML3 和 U937A2。该数据集面向白血病免疫治疗相关研究，尤其是移植后移植物抗白血病效应中次要组织相容性抗原的识别与验证。
【数据集背景】
移植物抗白血病效应是异基因造血干细胞移植后控制白血病复发的重要免疫机制，而次要组织相容性抗原（mHAs）是介导该效应的关键靶点之一。DISCOVeRY-BMT 数据集为系统性预测共享的移植物抗白血病 mHAs 提供了基础。该数据集正是在这一背景下构建，旨在从 DISCOVeRY-BMT 数据中预测共享的 mHAs，并借助质谱技术对预测结果进行实验验证，从而为白血病免疫治疗靶点的发现提供数据支撑。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，属于转录组或基因表达范畴。其数据内容主要包括五种 AML 细胞系——Nomo1、Monomac1、NB4、OCI-AML3 和 U937A2——的 RNAseq 读段计数分析结果。这些读段计数用于判断 mHA 源基因在相应细胞系中是否有非零表达，从而为预测 mHAs 及后续质谱验证提供表达层面的依据。数据集的分类归属为肿瘤/白血病，整体设计聚焦于 RNAseq 数据的读段计数分析。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJNA873278: Shared Graft Versus Leukemia Minor Histocompatibility Antigens in DISCOVeRY-BMT。其数据基础为 DISCOVeRY-BMT 数据集，分析对象为五种 AML 细胞系的 RNAseq 读段计数。验证环节采用质谱技术，在具有相应 HLA 等位基因且 mHA 源基因有非零 RNAseq 读数的细胞系中进行。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批及处理流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于移植物抗白血病次要组织相容性抗原的预测与验证研究，尤其是基于 DISCOVeRY-BMT 数据集的共享 mHAs 识别工作。由于涉及五种 AML 细胞系的 RNAseq 读段计数，可用于分析 mHA 源基因在白血病细胞系中的表达情况，并结合 HLA 等位基因信息筛选候选 mHAs。此外，该数据集也可为质谱验证实验的设计提供表达层面的参考，适用于白血病免疫治疗靶点发现、移植免疫相关研究以及转录组数据分析等场景。
【使用方法】
使用该数据集时，可基于五种 AML 细胞系的 RNAseq 读段计数，判断 mHA 源基因在各细胞系中是否具有非零表达，并结合相应 HLA 等位基因信息筛选候选 mHAs。预测得到的 mHAs 可通过质谱在具有相应 HLA 等位基因且源基因有非零 RNAseq 读数的细胞系中进行验证。关于数据下载方式、文件格式、分析流程的具体参数及软件工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的分析对象限定为五种 AML 细胞系（Nomo1、Monomac1、NB4、OCI-AML3 和 U937A2），验证依赖于具有相应 HLA 等位基因且 mHA 源基因有非零 RNAseq 读数的细胞系，因此结果适用范围受细胞系模型限制。关于数据质量评估指标、测序深度、重复数、批次效应及验证灵敏度等信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJNA873278: Shared Graft Versus Leukemia Minor Histocompatibility Antigens in DISCOVeRY-BMT。关于引用方式、许可协议及使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA873278
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为了从DISCOVeRY-BMT数据集中预测共享的移植物抗白血病次要组织相容性抗原（mHAs）。我们随后通过质谱法，在具有相应HLA等位基因且对应于mHA源基因的RNAseq读数非零的细胞系中验证了预测的mHAs。总体设计：分析五种AML细胞系（Nomo1、Monomac1、NB4、OCI-AML3和U937A2）的RNAseq数据读数计数。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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