PRJNA854901:慢性髓性白血病干细胞对酪氨酸激酶抑制的适应性代谢反应

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于肿瘤/白血病分类,主题为转录组或基因表达。源站描述围绕慢性髓性白血病(CML)中酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗对白血病干细胞代谢的影响展开,涉及有氧糖酵解、谷氨酰胺分解、TCA 循环和氧化磷酸化等通路,以及单细胞分析揭示的干细胞亚群富集现象

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA854901: Adaptive Metabolic Response to Tyrosine Kinase Inhibition in Chronic Myelogenous Leukemia Stem Cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

PRJNA854901:慢性髓性白血病干细胞对酪氨酸激酶抑制的适应性代谢反应

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于肿瘤/白血病分类,主题为转录组或基因表达。源站描述围绕慢性髓性白血病(CML)中酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗对白血病干细胞代谢的影响展开,涉及有氧糖酵解、谷氨酰胺分解、TCA 循环和氧化磷酸化等通路,以及单细胞分析揭示的干细胞亚群富集现象。数据可用于研究 CML 干细胞在 TKI 治疗下的代谢适应与持续存在机制(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):酪氨酸激酶抑制剂(TKI)在治疗慢性髓性白血病(CML)方面非常有效,但原始的静息 CML 干细胞持续存在,成为复发的来源。TKI 治疗对 CML 干细胞代谢的影响,以及代谢重编程在 TKI 治疗后 CML 干细胞持续存在中的作用尚不清楚。在这里我们表明,在 CML 小鼠模型中,TKI 治疗导致 CML 祖细胞中有氧糖酵解、谷氨酰胺分解、TCA 循环和氧化磷酸化(OXPHOS)的急性抑制,但这些通路随着持续 TKI 治疗而恢复。单细胞分析揭示,以较低 OXPHOS、糖酵解、核苷酸代谢和 MYC 基因特征为特征的原始 CML 干细胞亚群在 TKI 治疗后富集。TKI 治疗最初导致能量代谢基因特征的广泛抑制,但持续

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA854901

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

酪氨酸激酶抑制剂(TKI)在治疗慢性髓性白血病(CML)方面高度有效,但原始的静息CML干细胞持续存在,成为复发的来源。TKI治疗对CML干细胞代谢的影响,以及代谢重编程在TKI治疗后CML干细胞持续存在中的作用尚不清楚。在此,我们展示在CML小鼠模型中,TKI治疗导致CML祖细胞中有氧糖酵解、谷氨酰胺分解、TCA循环和氧化磷酸化(OXPHOS)的急性抑制,但随着TKI治疗的持续,这些通路得以恢复。单细胞分析揭示,以较低OXPHOS、糖酵解、核苷酸代谢和MYC基因特征为特点的原始CML干细胞亚群在TKI治疗后富集。TKI治疗最初导致能量代谢基因特征的广泛抑制,但持续治疗导致持续存在的干细胞发生代谢重编程,OXPHOS和MYC基因特征增强。TKI治疗增强了静息CML干细胞中HIF-1的活性,而添加HIF-1抑制剂显著耗竭了TKI治疗小鼠中的CML干细胞。

我们的结果确定了CML干细胞在TKI治疗后代谢适应的机制,这些机制可作为靶点以清除持续存在的静息CML干细胞。总体设计:我们使用可诱导的转基因SCL-tTA/BCR-ABL(BA)小鼠模型,研究了CML干/祖细胞在TKI治疗响应中的能量代谢变化。在该模型中,四环素撤除导致HSC中BCR-ABL表达并发展为CML样骨髓增殖性疾病。CML小鼠和正常小鼠接受BCR-ABL TKI尼洛替尼(50mg/kg,每日灌胃)或溶媒治疗。骨髓(BM)c-Kit+细胞用于生物能量学和代谢组学检测,以获得足够数量的细胞进行这些分析。然而,该细胞群主要由祖细胞组成,因此我们进行了

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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