PRJNA816449：急性髓系白血病化疗耐药的单细胞RNA测序研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA816449

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数据说明

引言 我们既往研究表明，myc、线粒体氧化磷酸化、mTOR及干性各自独立地导致AML化疗耐药。本研究旨在采用单细胞RNA测序（scRNA-seq）方法进一步揭示AML“7+3”诱导化疗耐药的潜在机制。方法 纳入13例未经治疗的初治AML患者，分为完全缓解（CR）组（n=8）和非CR组（n=5）。我们采用scRNA-seq分析这13例患者共28950个AML细胞的基因图谱。并使用既往发表的bulk RNA-seq数据集验证我们的结果。结果 化疗耐药的AML细胞在早期造血阶段存在更多过早累积。非CR组的造血干细胞样细胞较CR组表达更多白血病干细胞标志物（CD9、CD82、IL3RA和IL1RAP）。此外，化疗耐药的祖细胞因早期造血阻滞而出现髓系分化受损。重要的是，scRNA-seq和bulk RNA-seq分析的AML细胞显示出相当的髓系细胞比例，这从内部验证了我们的结果。

利用TCGA数据库，我们的分析表明，化疗耐药遗传标志物（IL3RA和IL1RAP）表达较高的AML患者总生存期较差（IL3RA的p < 0.01；IL1RAP的p < 0.05）。总体设计：检查急性髓系白血病骨髓细胞中2种不同的临床结局

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。