PRJNA792548：儿童急性髓系白血病转录组分析

资源简介

PRJNA792548：儿童急性髓系白血病转录组分析

PRJNA792548 是一个面向儿童急性髓系白血病（AML）的全转录组数据集，其英文全称为 Transcriptome Analysis of Pediatric Acute Myeloid Leukemia。该数据集依托高通量 RNA 测序技术，对儿童 AML 患者的髓母细胞（myeloblast）进行基因表达谱刻画，旨在为这一血液系统恶性肿瘤的转录层面研究提供系统的数据资源。数据集共纳入 48 例儿童 AML 病例，测序数据经质控过滤后比对至人类基因组参考序列（build hg38），并使用 Ensembl release 100 进行注释，每样本约获得 3000 万条可比对序列读段。该数据集归属于肿瘤／白血病分类，主题标签为转录组或基因表达，原始数据发布在 NCBI 站点，可供转录组学、肿瘤生物学及临床相关研究参考使用。

【数据集背景】

急性髓系白血病是儿童中较为少见但危害严重的血液系统恶性肿瘤，其发生发展涉及复杂的基因表达调控改变。该数据集的设计目的正是为儿童 AML 构建一份全转录组层面的数据集，通过 RNA 测序手段获取患儿白血病细胞的整体转录本信息，从而为理解该疾病的分子特征、探索潜在的生物标志物以及开展后续比较分析提供基础数据支撑。数据集以髓母细胞为研究对象，聚焦于白血病细胞本身的基因表达状态。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 48 例儿童急性髓系白血病病例髓母细胞的基因表达谱。数据以 RNA-seq 形式产生，属于转录组或基因表达主题。经优化的数据分析流程处理后，每个样本约有 3000 万条序列读段被比对到人类基因组（build hg38），并借助 Ensembl release 100 完成基因注释。由此形成的表达谱数据可用于基因水平的表达定量与转录组层面的比较研究。数据集整体设计为对儿童 AML 髓母细胞基因表达特征的集中呈现。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），英文名称为 PRJNA792548: Transcriptome Analysis of Pediatric Acute Myeloid Leukemia。样本来自 48 例儿童急性髓系白血病病例的髓母细胞。测序采用 Illumina 平台进行深度测序，产生的序列读段经过质量过滤后进入后续分析流程。数据集的原始发布站点为 NCBI，本站将其归入肿瘤／白血病分类之下，并标注主题标签为转录组或基因表达。

【适用场景】

基于其内容与设计，该数据集适用于儿童急性髓系白血病的转录组学研究，例如白血病细胞基因表达谱的描述性分析、不同病例间表达特征的比较、转录组数据挖掘以及与其他 AML 相关数据集的整合分析等。由于数据覆盖 48 例儿童病例并提供了比对与注释后的表达信息，也可作为方法学研究中 RNA-seq 分析流程的测试数据。具体应用方向应结合研究目的与数据实际内容确定，源站未提供更细化的适用场景说明。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI 站点获取该数据集。分析时可将测序读段比对至人类基因组 build hg38，并参照 Ensembl release 100 的注释信息进行基因水平定量。源站描述中提及采用了优化的数据分析流程，每样本约 3000 万条读段完成比对，使用者可据此评估数据规模并规划计算资源。关于具体的下载路径、文件组织方式与配套分析脚本，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集在产生过程中对测序读段进行了质量过滤，仅保留通过质量筛选的读段用于分析，并以约 3000 万条读段／样本的比对量及 hg38 与 Ensembl release 100 的注释作为数据基础。数据集仅包含 48 例儿童 AML 病例的髓母细胞表达谱，样本量与人群范围有限。关于批次效应、临床信息完整性、数据覆盖度评估等更详细的质量指标，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集发布在 NCBI 站点，英文名称为 PRJNA792548: Transcriptome Analysis of Pediatric Acute Myeloid Leukemia。关于具体的引用方式、数据使用许可条款及再分发规定，源站未提供。