Ph-like B细胞急性淋巴细胞白血病前临床模型中的致癌与器官浸润特异性治疗RNA-seq数据集2

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA791390

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们研究了IRF4缺失是否可能具有其他附带致癌效应，例如通过引起参与白血病发生的信号通路改变和转录变化。因此，第一步，我们将上述肿瘤10、11和14的基因表达与从Irf4–/–小鼠骨髓中分选出的B220+ mIgM- pro/preB细胞的基因表达进行了比较。第二步，将样本间差异超过两倍的基因缩减为仅那些我们发现受de novo IRF4表达改变的基因（图3E）。这种方法使我们能够聚焦于受IRF4调控且同时在白血病细胞与非转化pro/preB细胞之间发生改变的基因。最后，作为进一步的选择层次，将所得基因与Ochiai等人30提供的数据银行进行匹配，并筛选出在B细胞ChIP分析中与IRF4结合的基因。总体设计：本研究包括两个对照样本（gfp空载）和两个测试样本（irf4），两者均代表生物学重复。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。