PRJNA738461:急性髓系白血病患者骨髓间充质基质细胞显示成脂分化倾向并支持白血病细胞

该数据集来自 NCBI,属于肿瘤/白血病分类,主题为转录组或基因表达。数据针对正常供者与急性髓系白血病(AML)患者来源的骨髓间充质基质细胞(MSCs)进行比较,通过 RNA-Seq 分析识别差异表达与通路改变,发现 AML-MSCs 成脂潜能增加并增强对白血病祖细胞存活的支撑能力

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA738461: Bone marrow mesenchymal stromal cells from acute myelogenous leukemia patients demonstrate adipogenic differentiation propensity with implications for leukemia cell support

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

PRJNA738461:急性髓系白血病患者骨髓间充质基质细胞显示成脂分化倾向并支持白血病细胞

该数据集来自 NCBI,属于肿瘤/白血病分类,主题为转录组或基因表达。数据针对正常供者与急性髓系白血病(AML)患者来源的骨髓间充质基质细胞(MSCs)进行比较,通过 RNA-Seq 分析识别差异表达与通路改变,发现 AML-MSCs 成脂潜能增加并增强对白血病祖细胞存活的支撑能力。数据可用于研究白血病微环境中间充质基质细胞的转录组变化、成脂分化相关通路及对白血病细胞支持作用的分子基础(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):骨髓间充质基质细胞(MSCs)是造血微环境龛的重要组成成分之一。体外证据表明,骨髓 MSCs 能够支持白血病祖细胞的增殖和存活,并提供对细胞毒性治疗的抵抗。白血病骨髓来源的 MSCs 与正常对应细胞有何差异,以及它们如何受到白血病干、祖细胞存在的影响,仍不完全清楚。在本工作中,我们比较了正常供者(ND)和急性髓系白血病(AML)来源的 MSCs,发现 AML-MSCs 具有增加的成脂潜能,并具有改善的支持白血病祖细胞存活的能力。为识别潜在变化,进行了 RNA-Seq 分析。基因本体和通路分析揭示成脂作用是 AML-MSCs 中失调的 altered 生物学通路之一。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA738461

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数据说明

骨髓间充质基质细胞(MSCs)是造血微环境龛的重要组成成分之一。体外证据表明,骨髓MSCs能够支持白血病祖细胞的增殖和存活,并提供对细胞毒性治疗的抵抗。白血病骨髓来源的MSCs与正常对应细胞有何差异,以及它们如何受到白血病干/祖细胞存在的影响,目前仍不完全清楚。在本研究中,我们比较了正常供者(ND)和急性髓系白血病(AML)来源的MSCs,发现AML-MSCs的成脂潜能增加,且支持白血病祖细胞存活的能力增强。为识别潜在变化,进行了RNA-Seq分析。基因本体和通路分析显示,与ND-MSCs相比,成脂作用是AML-MSCs中失调的生物学通路之一。与ND-MSCs相比,AML-MSCs中SOX9和EGR2的表达均降低。提高SOX9的表达可降低AML-MSCs的成脂潜能,并减弱其支持AML祖细胞的能力。

这些发现表明,AML-MSCs具有成脂潜能,可能增强对白血病祖细胞的支持作用。总体设计:从三名不同的AML患者中分离出的三份骨髓来源MSC样本,以及从三名不同的ND对照供者中分离出的三份骨髓来源MSC,导致造血干细胞含量减少。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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