PRJNA702995：CDK7抑制剂THZ1通过干扰细胞代谢诱导B细胞急性淋巴细胞白血病细胞凋亡
该数据集来自NCBI，属于肿瘤/白血病分类，主题为转录组或基因表达。研究使用RNA测序分析CDK7抑制剂THZ1处理后的B细胞急性淋巴细胞白血病Nalm6细胞，比较THZ1与DMSO处理24小时的转录组变化，旨在探究THZ1对B-ALL细胞的抑制作用及机制
基本信息
资源简介
PRJNA702995：CDK7抑制剂THZ1通过干扰细胞代谢诱导B细胞急性淋巴细胞白血病细胞凋亡
PRJNA702995 数据集来自 NCBI，归属于肿瘤/白血病分类，主题为转录组或基因表达。该数据集围绕 CDK7 抑制剂 THZ1 对 B 细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的作用展开，采用 RNA 测序手段，比较 THZ1 处理与 DMSO 对照处理 24 小时后 Nalm6 细胞的转录组变化。CDK7 被视为潜在的肿瘤治疗靶点，THZ1 是首个选择性共价 CDK7 抑制剂，已在多种癌症中表现出抑制细胞增殖和诱导凋亡的抗肿瘤效应，但其对 B-ALL 细胞是否具有抑制作用及其机制尚不明确。该数据集正是为回答这一问题而产生，结果显示 THZ1 在体外扰动了 B-ALL 细胞的代谢通路。
【数据集背景】
CDK7 是潜在的肿瘤药物靶点。THZ1 作为首个选择性、共价结合的 CDK7 抑制剂，在多种癌症中通过抑制细胞增殖和诱导细胞凋亡发挥抗肿瘤作用。然而，THZ1 对 B 细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）细胞是否具有抑制作用，以及其背后的机制，此前并不清楚。为回答该问题，研究采集了经 THZ1 处理和 DMSO 处理的细胞进行 RNA 测序，以从转录组层面观察药物处理带来的基因表达变化，进而为理解 THZ1 在 B-ALL 中的作用方式提供数据基础。
【数据内容】
该数据集的主题标签为转录组或基因表达，核心内容是 RNA 测序所获得的基因表达数据。实验比较了两类处理条件：THZ1 处理与 DMSO 对照处理，处理时间为 24 小时，所用细胞为 B-ALL 细胞系 Nalm6。数据可用于分析药物处理前后转录组层面的差异，进而关联到细胞代谢通路的扰动。除上述处理与测序类型信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、数据量等更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。实验方法为：Nalm6 细胞以 1×10e6 cells/ml 的密度接种，分别用 500 nM THZ1 或 DMSO 处理 24 小时，随后收集细胞进行 RNA 测序。研究结果指出，THZ1 在体外扰动了 B-ALL 细胞的细胞代谢通路。数据集的英文名称为“PRJNA702995: CDK7 inhibitor THZ1 induces the cell apoptosis of B-cell acute lymphocytic leukemia by perturbing cellular metabolism”。
【适用场景】
该数据集适用于转录组与基因表达分析相关的研究场景，尤其是围绕 CDK7 抑制剂 THZ1 在 B 细胞急性淋巴细胞白血病中的作用机制探索。可用于比较 THZ1 处理与 DMSO 对照条件下 Nalm6 细胞的基因表达差异，考察药物处理对细胞代谢通路的扰动，并为理解 THZ1 诱导 B-ALL 细胞凋亡的转录组基础提供数据支持。也可作为肿瘤/白血病方向转录组研究的参考数据。源站未提供其他具体适用场景的说明。
【使用方法】
源站未提供。可依据 RNA 测序数据的通用分析思路，围绕 THZ1 与 DMSO 两组处理进行表达差异比较和通路层面分析，但具体分析流程、参数与步骤源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、批次信息、重复数量及技术限制的说明。已知实验仅在体外使用 Nalm6 细胞系、单一药物浓度 500 nM 与 24 小时处理条件，结果结论为体外水平，源站未提供其他验证或限制说明。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA702995
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目的：CDK7是治疗肿瘤的潜在药物靶点。THZ1是首个选择性共价CDK7抑制剂，通过抑制细胞增殖和诱导凋亡在多种癌症中显示出抗肿瘤作用。然而，THZ1对B-ALL细胞是否具有抑制作用及其潜在机制尚不清楚。为解决这一问题，我们收集了经THZ1和DMSO处理的细胞进行RNA测序。方法：将Nalm6细胞以1×10e6个/ml的密度接种，并用500nm THZ1或DMSO处理24小时。结果：THZ1在体外扰乱了B-ALL细胞的细胞代谢通路。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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