PRJNA597853：单细胞转录组分析揭示RNA剪接在白血病进展中的关键作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA597853

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

首先，我们从AML小鼠模型的四个不同时间点（T0、T1、T2和T3）提取了骨髓细胞。我们利用基于液滴的单细胞RNA测序技术，揭示了由Myc过表达引发的小鼠AML模型中早期MDS、晚期MDS、MDS-AML和AML四个阶段的图谱。此外，我们提取了一例AML患者的骨髓样本，按照10X genomics平台构建文库进行测序。并将该数据与来自10X genomics数据库的四例AML患者数据进行整合，以阐明TMEM134剪接事件在AML中的分子机制。为验证可变剪接结果，我们使用smartseq2在T3时间点构建了单细胞文库。结合TCGA-LAML和TARGET-AML数据库以及我们的小鼠功能数据，我们鉴定出TMEM134的可变剪接事件可驱动急性髓系白血病发生中的增殖功能。总体设计：白血病发生中的单细胞RNA测序（scRNA-seq）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。