PRJNA593281:C-miR146a处理后移植人白血病细胞小鼠骨髓NF-kB相关基因实时定量PCR分析

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 593281),主题为转录组或基因表达。数据内容是对移植了人白血病细胞的小鼠骨髓,在 C-miR146a 处理后,针对 NF-kB 相关基因进行实时定量 PCR 分析所产生的结果

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时间序列回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA593281: Real-time quantitative PCR analysis for NF-kB related genes of mouse bone marrow with engrafted human leukemia cells after C-miR146a treatment

基本信息

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创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA593281:C-miR146a处理后移植人白血病细胞小鼠骨髓NF-kB相关基因实时定量PCR分析

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 593281),英文名称为“Real-time quantitative PCR analysis for NF-kB related genes of mouse bone marrow with engrafted human leukemia cells after C-miR146a treatment”。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,本站分类归入肿瘤 / 白血病。数据内容是对移植了人白血病细胞的小鼠骨髓,在 C-miR146a 处理后,针对 NF-kB 相关基因进行实时定量 PCR 分析所产生的结果。该记录为研究者提供了一个集中入口,用于查找与这一项目相关的多种数据类型及其链接。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject,项目编号为 593281。BioProject 是围绕某一项单一研究计划而汇集的一组生物学数据,这些数据来自单一机构或一个联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,以便找到为该项目所产生的不同类型数据及其链接。本项目的核心研究对象是移植了人白血病细胞的小鼠骨髓,并在 C-miR146a 处理后,对 NF-kB 相关基因进行实时定量 PCR 分析。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,本站分类为肿瘤 / 白血病。

【数据内容】

该数据集的内容为实时定量 PCR 分析结果,分析对象是移植了人白血病细胞的小鼠骨髓,分析靶标为 NF-kB 相关基因,处理条件为 C-miR146a 处理。主题标签表明其属于转录组或基因表达范畴。源站未提供具体的基因列表、样本数量、表达量数值、统计学指标或原始数据文件格式等细节。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Real-time quantitative PCR analysis for NF-kB rela... (ID 593281) - BioProject - NCBI”。该记录属于 NCBI BioProject 数据库,项目编号 593281。源站描述指出,BioProject 记录提供用户一个单一位置,以查找为该项目生成的多种数据类型及其链接。关于具体的实验操作流程、样本采集时间、动物伦理审批信息、试剂来源或仪器型号等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与白血病、肿瘤微环境、NF-kB 信号通路以及 C-miR146a 功能相关的研究场景。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,其数据可用于基因表达分析、转录组相关研究,或作为验证其他高通量表达数据的参考。具体而言,涉及人白血病细胞异种移植小鼠模型、骨髓样本中 NF-kB 相关基因表达变化的研究,可能与本数据集相关。源站未提供更具体的适用场景说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录(ID 593281)访问该数据集,并利用 BioProject 提供的链接查找与该项目相关的不同数据类型。源站未提供具体的数据下载格式、分析流程、软件工具或操作步骤。因此,关于如何具体使用该数据集,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、重复性、批次效应、样本量、统计功效或技术验证等方面的信息。该数据集为实时定量 PCR 分析结果,其覆盖范围限于 NF-kB 相关基因,并非全转录组测序。主题标签虽为“Transcriptome or Gene expression”,但实际数据仅针对特定基因集。源站未提供其他限制说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用条款。用户如需引用或使用该数据集,应参考 NCBI BioProject 记录中可能提供的相关信息,或联系数据提交机构。源站未提供具体引用与许可细节。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA593281

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

NF-κB是炎症和癌症进展的关键调节因子,在白血病发生中具有重要作用。尽管具有治疗潜力,但使用药理抑制剂靶向NF-κB被证明具有挑战性。在此,我们描述了一种髓系细胞选择性NF-κB抑制剂,它使用与清道夫受体(SR)/Toll样受体9(TLR9)激动剂偶联的miR146a模拟寡核苷酸(C-miR146a)。与未偶联的miR-146a不同,C-miR146a被迅速内化并递送至靶髓系细胞和白血病细胞的细胞质中。C-miR146a降低了经典miR-146a靶标IRAK1和TRAF6的表达,从而阻断靶细胞中NF-κB的激活。向miR-146缺陷小鼠静脉注射C-miR146a模拟物可防止髓系细胞中过度的NF-κB激活,从而减轻髓系增殖和小鼠对细菌攻击的超敏反应。重要的是,C-miR146a在嵌合抗原受体(CAR)T细胞诱导的细胞因子释放综合征(CRS)的临床相关模型中显示出减轻严重炎症的功效。

系统性给予C-miR146a寡核苷酸可减轻异种移植B细胞淋巴瘤模型中依赖人单核细胞的IL-1和IL-6释放,而不影响CD19特异性CAR T细胞的抗肿瘤活性。除抗炎功能外,miR146a是一种已知的肿瘤抑制因子,在人类髓系白血病中常被缺失或表达水平降低。利用TCGA AML数据集,我们发现miR-146水平与NF-κB相关基因及患者生存率呈负相关。相应地,C-miR146a在体外对人MDSL、HL-60和MV4-11白血病细胞诱导了细胞毒性效应。重复静脉给予C-miR146a抑制了NF-κB靶基因的表达,从而阻止了播散性HL-60白血病的进展。我们的结果证明了使用靶向髓系细胞的miR146a模拟物治疗炎症性和骨髓增殖性疾病的潜力。NF-κB是炎症和c的关键调节因子

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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