PRJNA563916：MS5基质细胞与正常人造血干祖细胞及AML共培养的基因表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA563916

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

急性髓系白血病重塑骨髓非造血微环境，破坏龛结构及正常造血。该过程背后的精确相互作用尚不明确。我们采用微阵列技术详细解析健康间充质基质细胞与正常造血祖细胞/干细胞（HSPCs）及AML之间相互作用的全局基因表达程序。总体设计：在第一数据集（0611_DoB(5)）中，MS5小鼠间充质基质细胞（MSCs）单独培养或与AML细胞系在STEM CELL TECHNOLOGIES的myelocult H5100中共培养。在第二数据集（0610_DoB(2)和0910_DoB(2)）中，MS5间充质基质细胞单独培养，或与人脐带血CD34+细胞或AML患者样本AML7和AML8共培养。7天后，通过FACS分选MSCs，随后进行RNA提取并在Affymetrix微阵列上杂交。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。