PRJNA397377：人B细胞急性淋巴细胞白血病细胞配对样本（诊断与复发）测序
该数据集来自NCBI，聚焦人B细胞急性淋巴细胞白血病（ALL）细胞在药物治疗下的转录响应。样本取自同一患者诊断时（LAX7）和标准化疗三周后耐药时（LAX7R），耐药样本携带诊断时没有的KRASG12V突变
基本信息
资源简介
PRJNA397377：人B细胞急性淋巴细胞白血病细胞配对样本（诊断与复发）测序
PRJNA397377 数据集聚焦人B细胞急性淋巴细胞白血病（ALL）细胞在药物治疗下的转录响应，来源于 NCBI。研究对同一患者诊断时（LAX7）与接受标准化疗三周后出现耐药时（LAX7R）的配对样本进行测序，耐药样本携带诊断时未出现的 KRASG12V 突变。该数据集属于肿瘤/白血病分类，主题标签为转录组或基因表达，整体设计为对人B细胞急性淋巴细胞白血病细胞总RNA转录水平的全基因组分析，可用于观察B细胞在急性淋巴细胞白血病中对药物处理的转录变化。
【数据集背景】
该数据集关注的核心问题是B细胞急性淋巴细胞白血病细胞如何对药物治疗产生转录层面的响应。研究纳入同一患者的配对样本，分别代表诊断阶段（LAX7）和耐药发生之后（LAX7R）的状态。患者在诊断后接受了为期三周的标准化疗方案，药物包括长春新碱、地塞米松、L-天冬酰胺酶和多柔比星。耐药样本中出现了诊断样本中不存在的 KRASG12V 突变，这一特征为理解耐药前后的分子差异提供了背景信息。数据集所属分类为肿瘤/白血病，主题方向为转录组或基因表达。
【数据内容】
该数据集的内容为全基因组范围内的总RNA转录水平谱，研究对象是人B细胞急性淋巴细胞白血病细胞。样本来自同一患者的诊断样本（LAX7）和耐药样本（LAX7R），构成配对设计。数据用于刻画B细胞在药物治疗背景下转录水平的变化，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。关于样本数量、测序平台、读长、数据量、文件格式等具体技术参数，源站未提供。
【采集与来源】
样本取自一名B细胞急性淋巴细胞白血病患者，分别在诊断时和标准化疗三周后耐药时获得。患者来源的细胞被直接移植到 NOD/SCIDγc-/- 小鼠体内，随后以冻存形式保存为库存。数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为“PRJNA397377: Sequencing of matched pair samples (diagnosis and relapse) in human B-cell acute lymphoblastic leukemia cells (ALL)”。关于采集时间点、伦理审批、知情同意及具体处理方法等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究人B细胞急性淋巴细胞白血病在药物治疗下的转录响应，尤其是诊断与耐药配对样本之间的基因表达差异分析。由于耐药样本携带诊断时没有的 KRASG12V 突变，数据可用于探索与耐药出现相关的转录特征。主题标签表明其用途集中在转录组或基因表达分析方向。关于具体的临床应用或药物靶点验证场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集为总RNA转录水平谱数据，可用于全基因组表达层面的比较分析。使用时应关注其配对设计特点，即同一患者诊断样本与耐药样本的对应关系。关于数据下载方式、预处理流程、分析工具及参数设置等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于同一患者的配对样本，样本来源明确，并记录了耐药样本的 KRASG12V 突变信息。其局限在于样本仅来自单一患者，关于重复样本数量、测序深度、数据质控指标及批次效应等信息，源站未提供。使用时应结合这些未提供的信息谨慎解释结果。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI，英文名称为 PRJNA397377。关于引用方式、许可条款及使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA397377
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该实验聚焦于急性淋巴细胞白血病（ALL）中B细胞对药物治疗的转录反应。我们从一名患者诊断时（LAX7）以及接受标准3周化疗方案（长春新碱、地塞米松、L-天冬酰胺酶和多柔比星）后出现耐药时（LAX7R）获取了B细胞样本。耐药样本携带诊断时并不存在的KRASG12V突变。从患者获得的细胞被直接移植到NOD/SCIDγc-/-小鼠体内，随后冷冻保存为储备细胞。总体设计：对人B细胞急性淋巴细胞白血病细胞（ALL）中总RNA转录本水平进行全基因组分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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