肺移植后慢性肺移植物功能障碍患者全血基因表达
数据可用于研究肺移植后慢性肺移植物功能障碍相关的基因表达变化，支持转录组层面的分类与比较分析。本站将其归入肿瘤 / 白血病分类（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
肺移植后慢性肺移植物功能障碍患者全血基因表达
PRJNA371499 是一个围绕全血基因表达展开的公开数据集，其完整英文名称为 Whole blood gene expression from lung transplanted patients with chronic lung allograft dysfunction。该数据集聚焦于肺移植受者群体，旨在通过全血样本的转录组层面检测，刻画与慢性肺移植物功能障碍相关的基因表达变化。从数据主题来看，它属于转录组或基因表达范畴，可用于比较不同样本之间的表达差异，并支持在此基础上开展分类与对比分析。该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 体系，源站将其标注为 Homo sapiens，即人类来源。本站依据来源信息将其归入肿瘤 / 白血病分类，但这一分类来自本站的归类方式，并不改变数据集本身以肺移植后慢性肺移植物功能障碍为核心的研究语境。整体而言，该数据集为研究肺移植后慢性肺移植物功能障碍的分子表达特征提供了可检索、可关联的转录组数据入口。
【数据集背景】
该数据集对应的项目编号为 PRJNA371499，英文名称明确指出其研究对象是接受肺移植并出现慢性肺移植物功能障碍的患者，检测材料为全血，检测层面为基因表达。慢性肺移植物功能障碍是肺移植后需要长期关注的问题，而全血基因表达能够从外周血角度反映机体在移植后状态下的转录活动变化。BioProject 作为生物数据的集合，通常围绕某一项研究计划或某一机构、联盟发起的工作进行组织，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。因此，PRJNA371499 可以被视为一个以肺移植后慢性肺移植物功能障碍为主题、以人类全血转录组为数据类型的项目记录。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，说明其核心数据属于转录组或基因表达类。数据内容围绕全血样本中的基因表达信息展开，可用于观察肺移植后慢性肺移植物功能障碍相关的表达变化。源站描述指出，BioProject 记录会汇集与单一研究计划相关的生物数据，并提供链接以访问该项目生成的不同数据类型。就本数据集而言，其数据类型指向基因表达，因而适合在转录组层面进行样本间的分类与比较分析。关于具体样本数量、基因数量、表达矩阵格式、分组设计、临床变量、测序平台或统计结果等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 资源，项目编号为 PRJNA371499，物种标注为 Homo sapiens。其英文名称表明样本来自肺移植后出现慢性肺移植物功能障碍的患者，检测材料为全血。源站描述仅对 BioProject 的性质作出通用说明，即 BioProject 是围绕单一研究计划、由单一组织或联盟发起的一组生物数据集合，并为用户提供查找该项目多种数据类型链接的统一位置。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批、知情同意、具体机构或研究团队等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于研究肺移植后慢性肺移植物功能障碍相关的基因表达变化，支持转录组层面的分类与比较分析。具体而言，研究人员可以在全血基因表达层面比较不同样本或不同组别之间的表达模式，探索与慢性肺移植物功能障碍相关的转录特征。由于本站将其归入肿瘤 / 白血病分类，该数据集也可能被用于该分类体系下的检索与组织，但这一归类来自本站，源站并未将其描述为肿瘤或白血病研究。关于该数据集是否适用于诊断、预后、治疗靶点发现或临床决策等具体应用，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录访问该数据集，并借助 BioProject 提供的链接查找该项目生成的不同数据类型。由于该数据集的主题为转录组或基因表达，使用者可在获取表达数据后开展转录组层面的比较与分类分析。关于数据下载方式、文件格式、分析流程、标准化方法、软件工具或代码示例等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号和物种信息明确，主题标签指向转录组或基因表达。其英文名称说明样本来自肺移植后慢性肺移植物功能障碍患者的全血。然而，关于样本量、数据完整性、测序深度、表达定量方法、批次效应、临床注释、质量控制指标以及是否存在缺失或偏差等信息，源站未提供。本站将其归入肿瘤 / 白血病分类，这一分类与源站标题和描述中呈现的肺移植后慢性肺移植物功能障碍主题并不直接对应，使用时需注意分类来源。关于数据的具体质量评估与使用限制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录，项目编号为 PRJNA371499。关于引用方式、许可条款、使用限制或数据共享政策等具体信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA371499
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
慢性肺移植物功能障碍（CLAD）限制了肺移植后的长期生存。CLAD在肺功能下降时才被晚期诊断，此时任何免疫干预均已无效。因此，识别CLAD的早期前兆对于在移植物发生不可逆损伤之前阻止疾病进展至关重要。我们利用全血细胞的大规模基因表达谱分析来识别闭塞性细支气管炎综合征（BOS）——CLAD的主要形式——的早期生物标志物。对80例患者（40例稳定（STA）和40例BOS）进行的微阵列实验识别出47个在STA与BOS受者之间差异表达的基因。随后使用一组独立患者（13例STA，11例BOS）通过qPCR进行外部验证。POU Class 2 Associating Factor 1（POU2AF1）、T-cell leukemia/lymphoma protein 1A（TCL1A）和B-cell lymphocyte kinase（BLK）基因被识别并验证为BOS的诊断前6个月以上的预测标志物，其AUC分别为0.83、0.77和0.78。
这些基因能够根据CLAD风险进行分层（对数秩检验p<0.01），并可能为临床医生提供新工具，以改善对可能发展为BOS的患者的随访和调整治疗。总体设计：本数据集展示了使用Agilent SurePrint G3人类基因表达v3 8x60K微阵列，对从80名患者（40名稳定（STA）和40名BOS）采集于PAXgene中的外周血样本进行的基因表达谱分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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