PRJNA285773:Tetraspanin 3 是急性髓系白血病发生与传播所必需
该数据集来自 NCBI,属于肿瘤/白血病分类下的转录组或基因表达主题数据。研究从野生型与 Msi2 突变型 MLL-AF9 驱动的 AML 及 BCR-ABL/NUP98-HOXA9 驱动的 bcCML 小鼠中提取白血病干细胞,每组设三个重复,提取 RNA 后杂交至 Affymetrix 微阵列

基本信息
资源简介
PRJNA285773:Tetraspanin 3 是急性髓系白血病发生与传播所必需
该数据集来自 NCBI,属于肿瘤/白血病分类下的转录组或基因表达主题数据。研究从野生型与 Msi2 突变型 MLL-AF9 驱动的 AML 及 BCR-ABL/NUP98-HOXA9 驱动的 bcCML 小鼠中提取白血病干细胞,每组设三个重复,提取 RNA 后杂交至 Affymetrix 微阵列。数据可用于分析 Msi2 缺失后 bcCML 与 de novo AML 干细胞中发生变化的基因,进而研究 Msi2 在髓系白血病中的调控作用(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Msi2 是髓系白血病的关键调控因子,这些数据鉴定了 bcCML 和 de novo AML 干细胞中 Msi2 缺失后发生变化的基因。总体设计:从野生型和 Msi2 突变型 MLL-AF9 驱动的 AML 及 BCR-ABL/NUP98-HOXA9 驱动的 bcCML 中提取白血病干细胞,设三个重复。提取 RNA 并杂交至 Affymetrix 微阵列。小鼠品系为熊本大学动物资源与开发中心(CARD)制作的遗传陷阱 Msi2 突变体。他们称其品系为 B6;CB-Msi2Gt(pU-21T)2Imeg,另见
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA285773
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA285773
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Msi2是髓系白血病的关键调控因子,这些数据鉴定了在bcCML和de novo AML干细胞中Msi2缺失后发生改变的基因。总体设计:从野生型和Msi2突变型MLL-AF9驱动的AML以及BCR-ABL/NUP98-HOXA9驱动的bcCML中提取白血病干细胞,设三个重复。提取RNA并杂交至Affymetrix微阵列。小鼠品系为熊本大学动物资源与开发中心(CARD)制作的基因捕获Msi2突变体。他们将该品系称为B6;CB-Msi2Gt(pU-21T)2Imeg,另见http://cardb.cc.kumamoto-u.ac.jp/transgenic/strainsDetailAction.do?strainId=834
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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