基本信息

模态

基因组

任务类型

回归

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA282787：急性髓系白血病中NPM1突变调控的microRNA−mRNA调控 [miRNA]

PRJNA282787 是一个围绕急性髓系白血病（AML）中 NPM1 突变如何影响 microRNA 与 mRNA 调控关系而建立的公开生物项目数据集，英文全称为 NPM1 mutation-modulated microRNA−mRNA regulation in acute myeloid leukemia [miRNA]。该数据集归属于肿瘤／白血病这一分类，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，说明其核心内容属于转录组或基因表达层面的数据。数据来源为 NCBI BioProject，源站标题标注为 Homo sapiens（ID 282787）。整体来看，该数据集可用于研究 NPM1 突变相关的 microRNA−mRNA 调控机制，并支持白血病分子特征分析与表达调控层面的探索，适合关注 AML 分子机制、非编码 RNA 调控以及基因表达变化的研究人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 PRJNA282787，物种标注为 Homo sapiens。其研究背景聚焦于急性髓系白血病中 NPM1 突变对 microRNA 与 mRNA 调控关系的影响。NPM1 突变是急性髓系白血病中受到关注的分子事件之一，而 microRNA 与 mRNA 之间的调控关系是转录后表达调控研究的重要内容。该数据集将这两方面结合起来，属于肿瘤／白血病方向下转录组或基因表达类数据。源站描述指出，BioProject 是围绕某一单一研究计划汇集生物数据的记录，来源于单一机构或联合体，并为用户提供一个集中入口，以查找该项目产生的多种数据类型。因此，该数据集可被理解为与 NPM1 突变调控 microRNA−mRNA 关系这一研究计划相关的数据集合。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其内容与转录组或基因表达相关。数据集名称中包含 [miRNA]，提示其涉及 microRNA 层面的数据。结合数据集名称，其内容围绕 NPM1 突变背景下 microRNA 与 mRNA 的调控关系展开。关于具体样本数量、测序平台、数据文件格式、表达矩阵、差异表达结果或调控网络等细节，源站未提供。该数据集所属分类为肿瘤／白血病，说明其应用语境与白血病分子研究相关。整体而言，数据内容应理解为与急性髓系白血病中 NPM1 突变、microRNA 和 mRNA 调控相关的转录组或基因表达数据集合，但更细粒度的数据组成信息源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 Homo sapiens（ID 282787） - BioProject - NCBI。项目英文名为 PRJNA282787: NPM1 mutation-modulated microRNA−mRNA regulation in acute myeloid leukemia [miRNA]。源站描述说明，BioProject 记录用于汇集与单一研究计划相关的生物数据，这些数据可能来自单一机构或联合体，并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、实验设计细节、测序方法或数据处理流程等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究急性髓系白血病中 NPM1 突变相关的 microRNA−mRNA 调控机制。具体而言，可用于探索 NPM1 突变如何影响 microRNA 与 mRNA 之间的表达调控关系，也可支持白血病分子特征分析与表达调控层面的研究。由于其主题标签为 Transcriptome or Gene expression，该数据集还可用于转录组或基因表达相关的分析场景。对于关注肿瘤／白血病分子机制、非编码 RNA 调控以及基因表达变化的研究人员，该数据集具有参考价值。关于更具体的适用分析类型、疾病亚型分层或临床关联研究，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 获取，项目编号为 PRJNA282787，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。用户可依据该 BioProject 记录查找与项目相关的数据类型和链接。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供一个集中位置，以查找为该项目生成的多种数据类型。关于具体下载方式、文件格式、分析工具、预处理步骤或复现流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开生物项目记录。其主题标签为 Transcriptome or Gene expression，分类为肿瘤／白血病，物种为 Homo sapiens。关于数据质量指标、样本量、测序深度、覆盖度、批次效应、缺失值情况或验证实验结果等，源站未提供。由于源站描述主要解释 BioProject 的通用性质，而非该项目的具体实验细节，因此在使用时需注意数据集的具体内容边界和适用范围可能受限于源站未提供的细节。任何关于数据完整性、偏倚或可重复性的判断，源站未提供。

【引用与许可】

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE68467

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA282787

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

核磷蛋白（NPM1）基因突变在急性髓系白血病（AML）中较为常见。该突变具有显著的预后意义，并与独特的生物学特征相关。我们来自初诊AML患者样本配对的微小RNA（miRNA）和mRNA微阵列数据强烈表明，miRNA−mRNA调控（MMR）可能是动态的，并可由NPM1突变调节。我们通过一个系统框架识别了493对受NPM1突变调控的MMR配对，其中MMR在携带NPM1突变的患者中特异性减弱。涉及的miRNA/mRNA与癌症和血液病相关，也与NPM1突变的已知功能相关，包括细胞死亡和细胞对治疗的反应。NPM1突变调控可通过三种方法验证，包括两个独立队列数据集、一个源自基于细胞系实验的高通量数据集，以及两个体外模型。我们的研究为NPM1突变作为MMR调节因子的作用提供了新的生物学见解，并据此在AML中衍生出新的预后标志物。总体设计：从109例初诊AML患者中获取冷冻保存的骨髓细胞。

每个样本均使用nCounter®人类miRNA表达阵列进行分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别