PRJNA281006：成髓细胞向单核细胞分化转变过程中转录后调控网络的鉴定 [mRNA]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA281006

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

用1,25-二羟维生素D3处理白血病细胞可能克服其分化阻滞，导致从成髓细胞向单核细胞转变。为识别与髓系分化相关的microRNA-mRNA网络，我们分析了白血病细胞及其分化后的单核细胞对应物中与低密度和高密度核糖体组分相关的mRNA和microRNA的表达。将处理后在不同组分间发生转移的mRNA与受调控microRNA的推定靶基因取交集，揭示了一系列与单核细胞命运决定相关的分子网络。在本数据集中，我们纳入了对增殖中的HL60细胞以及经1,25-二羟维生素D3（VitD3）处理诱导分化的细胞中核糖体/多聚核糖体相关miRNA和mRNA进行分析所获得的表达数据。总体设计：共18个样本，其中9个来自对照增殖的HL60细胞，9个来自VitD3处理的HL60细胞。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。