PRJNA271257：白血病细胞中CD82调控EZH2及BCL2L12的转录组数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA271257

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数据说明

我们最近发现，四跨膜蛋白家族成员CD82在化疗耐药的CD34+/CD38−急性髓系白血病（AML）细胞中异常表达，负向调控基质金属蛋白酶9，并在使CD34+/CD38− AML细胞黏附于骨髓微环境方面发挥重要作用。本研究探讨了CD82有助于AML进展的新功能。我们采用微阵列分析，比较转导CD82 shRNA的CD34+/CD38− AML细胞与转导对照shRNA的CD34+/CD38− AML细胞之间的基因表达谱。采用实时RT-PCR和蛋白质印迹分析检测CD82敲低对白血病细胞中多梳家族成员zeste同源物增强子2（EZH2）表达的影响。采用染色质免疫沉淀试验检测CD82表达对白血病细胞中EZH2与抑癌基因启动子区域结合量的影响。我们还利用甲基化特异性PCR检测CD82表达是否影响白血病细胞中抑癌基因启动子区域的甲基化状态。

微阵列分析显示，在CD34+/CD38− AML细胞中，shRNA介导的CD82敲低后EZH2水平下降。此外，抗体介导的白血病细胞中CD82阻断通过激活p38 MAPK信号通路降低了EZH2表达，减少了EZH2与肿瘤抑制基因启动子区域的结合量，并抑制了这些启动子区域组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化，从而导致肿瘤抑制因子在mRNA和蛋白质水平上调。本研究旨在探讨一种四跨膜蛋白家族成员——CD82——在化疗耐药的CD34+/CD38−急性髓系白血病（AML）细胞中异常表达的生物学功能。对患者分离的CD34+/CD38− AML细胞进行微阵列分析显示，抗凋亡蛋白BCL2L12的水平下调

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。