PRJNA267255：富集白血病干细胞的群体表达自我更新基因表达特征 [RNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA267255

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

突变RAS癌蛋白激活的信号分子在包括急性髓系白血病（AML）在内的多种人类肿瘤中驱动肿瘤发生。然而，这些通路在AML中的具体功能尚不清楚。为了阐明激活的NRAS在AML中的下游功能，我们采用了一种携带Mll-AF9和NRASG12V的AML小鼠模型。我们发现NRASG12V增强了白血病自我更新基因表达特征，并且是维持MLL-AF9和MYB依赖的基因表达程序所必需的。在对RAS依赖性信号中间分子的多重分析中，白血病干细胞区室对RAS撤除优先敏感。使用RAS通路抑制剂表明，NRASG12V通过mTOR和MEK通路激活维持白血病自我更新，提示这些通路可作为癌症干细胞特异性治疗的潜在靶点。总体设计：从脾脏收集的原代白血病细胞被分选为免疫表型亚群（Mac-1High、Mac-1LowKit–Sca-1–、Mac-1LowKit+Sca-1–和Mac-1LowKit+Sca-1+）。从这些细胞亚群中提取RNA并提交进行RNA测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。