基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA157835：原发性浆细胞白血病中miRNA表达模式及其对多发性骨髓瘤肿瘤进展的意义

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 157835），主题物种为 Homo sapiens，聚焦原发性浆细胞白血病中 miRNA 的表达模式，并探讨其对多发性骨髓瘤肿瘤进展的意义。从分类上看，它属于肿瘤与白血病相关研究范畴，主题标签指向转录组或基因表达方向。BioProject 作为生物数据的集合，通常围绕某一项单一研究计划组织，来源于单一机构或联合体，并为用户提供一个集中入口，以查找该项目所产生的多种数据类型。因此，该数据集可被理解为一项以人类样本为基础、围绕 miRNA 表达展开的转录组研究项目，其核心关注点在于原发性浆细胞白血病这一特定疾病背景下的表达特征，以及这些特征与多发性骨髓瘤肿瘤进展之间的潜在联系。对于希望了解浆细胞肿瘤分子表达谱的研究人员而言，该数据集提供了一个可追溯、可链接的项目级资源入口。

【数据集背景】

该数据集的英文名称为“PRJNA157835: Patterns of miRNA expression in primary plasma cell leukemias: implications for tumor progression in multiple myeloma”。从名称可以看出，研究围绕原发性浆细胞白血病中 miRNA 的表达模式展开，并将其意义延伸至多发性骨髓瘤的肿瘤进展。源站标题为“Homo sapiens (ID 157835) - BioProject - NCBI”，表明该项目在 NCBI BioProject 中以人类为对象进行登记。本站将其归类为肿瘤 / 白血病，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据层面与转录组或基因表达相关。整体而言，该项目处于浆细胞肿瘤分子机制研究的语境中，关注 miRNA 这一类调控性小分子在疾病进展中的表达变化。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，指向转录组或基因表达数据。其研究焦点是原发性浆细胞白血病中 miRNA 的表达模式，并涉及这些模式对多发性骨髓瘤肿瘤进展的意义。关于具体的样本数量、测序平台、miRNA 种类、表达矩阵、差异表达结果或统计指标，源站未提供。因此，无法进一步说明数据文件中包含哪些具体字段、采用何种检测方法或产生哪些定量结论。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，登记于 NCBI BioProject，项目编号为 157835。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划组织的生物数据集合，来源于单一机构或联合体，并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。该项目的主题物种为 Homo sapiens。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体研究机构或联合体名称，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与疾病分类，该数据集可适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是围绕浆细胞肿瘤、白血病以及 miRNA 表达调控的探索。其名称中提及原发性浆细胞白血病与多发性骨髓瘤肿瘤进展，因此可能适合用于比较不同浆细胞疾病状态下的 miRNA 表达模式，或用于探索 miRNA 在肿瘤进展中的潜在作用。关于该数据集是否适用于临床诊断、预后判断、药物靶点筛选或跨物种比较等具体应用，源站未提供明确说明。

【使用方法】

该数据集以 NCBI BioProject 记录的形式提供，用户可通过 BioProject 入口查找该项目所链接的多种数据类型。源站描述强调，BioProject 记录为用户提供一个集中位置，以发现为该项目生成的不同数据类型。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具或代码示例，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集登记于 NCBI BioProject，具备项目级编号与来源站点信息。其主题标签明确指向转录组或基因表达，研究主题涉及原发性浆细胞白血病与多发性骨髓瘤。然而，关于样本量、数据完整性、测序深度、质控标准、批次效应、重复性验证或统计效力等质量相关指标，源站未提供。此外，关于该数据集是否存在使用限制、是否仅限特定研究用途，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 PRJNA157835。关于具体的引用格式、作者列表、发表文献、许可协议或使用条款，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE37053

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA157835

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

原发性浆细胞白血病（pPCL）是一种罕见且极具侵袭性的浆细胞恶病质。迄今为止，尚无关于pPCL中微小RNA表达的信息报道。为了探究miRNA在pPCL中的作用，我们分析了来自18例先前未经治疗、纳入前瞻性临床试验的患者的高度纯化恶性浆细胞的全局miRNA表达谱。我们在该疾病的分子异常背景下评估了miRNA表达模式，并与具有代表性的多发性骨髓瘤（MM）患者队列进行了比较。我们在pPCL中鉴定出一系列失调的miRNA（42个上调，41个下调），这些miRNA可能在促进MM肿瘤进展中发挥作用。此外，我们将miRNA和基因表达数据与miRNA靶点的计算预测相结合，发现MM与pPCL之间差异表达的miRNA能够调控在癌症中具有重要功能的基因。

总体而言，我们的研究首次尝试探讨miRNAs在pPCL中的参与情况，可能有助于开发功能性方法，以研究侵袭性浆细胞恶液质形式中失调miRNAs的活性及其作为新型治疗靶点的可能作用。总体设计：本系列微阵列实验包含从39例诊断时的多发性骨髓瘤（MM）和18例原发性浆细胞白血病（pPCL）患者中获得的纯化浆细胞（PCs）的microRNA图谱。在使用0.86%氯化铵裂解红细胞后，使用CD138免疫磁珠从骨髓标本中纯化PCs。通过形态学和流式细胞术评估阳性选择的PCs纯度，所有病例中均>90%。按照制造商方案（Agilent Technologies）处理500纳克总RNA以生成Cy3标记的RNA，随后在色谱柱（Micro Biospin 6, Bio-Rad, Hercules, CA）上纯化，然后与Agilent微阵列杂交。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别