PRJNA1453398：合成锌指蛋白直接胞内递送破坏MYB–TAL1致癌轴

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1453398

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）蛋白1（TAL1）是髓系细胞定向分化中的重要转录因子，并正向调控红细胞分化。由短DNA序列插入所介导的TAL1异常高水平表达，可招募转录因子MYB并促成超级增强子的形成，从而导致T-ALL。在携带TAL1相关突变的T-ALL细胞系Jurkat细胞中，靶向MYB结合位点的合成锌指（ZF）DNA结合蛋白（ZF-Myb）以高亲和力结合DNA，并能有效竞争性排挤MYB。ZF-Myb的表达降低了Jurkat细胞中TAL1的表达及细胞增殖。引入Krüppel相关盒（KRAB）可使ZF-Myb的DNA结合亲和力提高四倍，并更有效地降低TAL1表达和Jurkat细胞生长。基于电荷互补的共组装标签（CATCH）新型肽可形成蛋白颗粒，显著增强了直接递送KRAB-ZF-Myb蛋白的效率。

转录组分析显示，使用合成的KRAB-ZF-Myb蛋白下调TAL1会破坏TAL1-MYB致癌轴并诱导促凋亡基因的表达。总之，利用一种新型高效直接蛋白递送系统，靶向超级增强子中单个位点的合成ZF蛋白可破坏T-ALL中的致癌通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。