基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

正常B细胞与慢性淋巴细胞白血病B细胞在Wnt3a处理前后的表达数据

该数据集为 NCBI BioProject 收录的人类转录组表达数据项目，编号 144867，英文名称为 PRJNA144867: Expression data from normal B cells and chronic lymphocytic leukemia B cells -- with/without treatment of Wnt3a。项目聚焦于正常 B 细胞与慢性淋巴细胞白血病（CLL）B 细胞的基因表达特征，并设置有无 Wnt3a 处理两种实验条件，用于比较不同细胞状态及处理因素下的转录组差异。数据归类于肿瘤 / 白血病方向，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，属于基因表达类生物项目，适合关注 B 细胞生物学及 CLL 相关转录组研究的人员参考使用。

【数据集背景】

该数据来源于 NCBI BioProject，项目编号为 144867。BioProject 是围绕某一项研究计划或计划集合而建立的生物数据归档记录，通常由单一机构或联合体发起，旨在为用户提供统一入口，以便查找同一项目下产生的多种数据类型。本项目即属于此类归档记录，其研究主题涉及正常 B 细胞与慢性淋巴细胞白血病 B 细胞的表达数据，并包含有无 Wnt3a 处理的条件设置。慢性淋巴细胞白血病是一种涉及 B 细胞的血液系统恶性肿瘤，因此该数据集被归入肿瘤 / 白血病分类。项目主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其核心数据类型为转录组或基因表达信息。

【数据内容】

该数据集收录正常 B 细胞与慢性淋巴细胞白血病 B 细胞的表达数据，并包含有无 Wnt3a 处理两种条件。这意味着数据在细胞类型维度上覆盖正常 B 细胞与 CLL B 细胞，在处理维度上覆盖未处理与 Wnt3a 处理。表达数据的具体检测平台、样本数量、基因数量、表达值单位、差异表达分析结果等细节，源站未提供。数据主题标签为 Transcriptome or Gene expression，说明其内容属于转录组或基因表达范畴。除上述信息外，源站未提供更多关于数据文件格式、数据量大小或具体表达矩阵结构的信息。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 Homo sapiens (ID 144867) - BioProject - NCBI。项目编号为 PRJNA144867，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供单一入口，以查找为该项目生成的多种数据类型。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、受试者来源、细胞分离方法、Wnt3a 处理浓度与时长等实验细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是涉及正常 B 细胞与慢性淋巴细胞白血病 B 细胞比较的研究。由于包含有无 Wnt3a 处理两种条件，也可用于探索 Wnt3a 处理对 B 细胞或 CLL B 细胞表达谱影响的场景。其主题标签为 Transcriptome or Gene expression，因此适合基因表达分析、转录组数据挖掘等用途。关于该数据集是否适用于特定临床诊断、药物开发或生物标志物验证等具体应用，源站未提供相关说明。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录进行访问，项目编号为 PRJNA144867，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。用户可在 BioProject 记录中查找与该项目相关的多种数据类型链接。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具或代码示例，源站未提供。因此，无法依据现有信息给出详细的操作步骤或分析建议。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开归档记录。关于数据质量评估指标、样本重复数、测序深度、数据完整性、批次效应控制、归一化方法等信息，源站未提供。该数据集仅涉及正常 B 细胞与 CLL B 细胞，并包含有无 Wnt3a 处理条件，但样本量、人群背景、疾病分期、治疗史等可能影响解读的因素，源站未提供。因此，在使用该数据集时，应结合原始记录中的具体信息进行判断，避免超出数据本身所能支持的结论。

【引用与许可】

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE31048

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA144867

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Wnt通路在CLL中失调——我们通过该数据集表征了正常B细胞和CLL-B细胞中的Wnt通路基因表达，并鉴定了正常B细胞和CLL-B细胞中的Wnt靶基因。在该数据集中，我们纳入了正常B细胞和CLL-B细胞以分析Wnt通路基因表达。这导致鉴定出62个在正常B细胞和CLL-B细胞之间差异表达的Wnt通路组分。我们还纳入了经或未经Wnt3a处理的正常B细胞和CLL-B细胞，并分别在正常B细胞和CLL-B细胞中鉴定出468个和676个Wnt调控基因。总体设计：使用24个正常B细胞和179个CLL-B细胞进行Wnt通路基因表达分析。在鉴定Wnt调控靶基因时纳入了三个正常样本和三个CLL样本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别