长春新碱通过下调Tssk4和Ccdc159诱导B-ALL PDX小鼠模型生精损伤的RNA-seq转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1392611

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)患者来源异种移植(PDX)小鼠模型睾丸组织的RNA测序(RNA-seq)数据，该模型经长春新碱(VCR)处理。本研究旨在阐明VCR诱导生殖毒性的分子机制。样本采集自多个实验组，包括正常对照(NC)、荷白血病对照(ALL)以及具有不同白血病浸润水平的VCR处理组。转录组分析显示，VCR暴露后基因表达发生广泛扰动，对精子发生和精子鞭毛组装至关重要的基因显著下调。该数据为理解VCR在睾丸微环境中影响的遗传通路提供了全面的资源。总体设计：对五组PDX小鼠睾丸组织进行RNA-seq分析：正常对照(NC)、B-ALL模型对照(ALL)、仅VCR处理组，以及具有低(Low-VCR)和高(High-VCR)外周血白血病浸润的VCR处理组。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。