PRJNA1371953:毛细胞白血病患者癌细胞单细胞转录组图谱
该数据集为单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,来自两名毛细胞白血病(HCL)及变异亚型(HCLv)患者,二者均表达未突变的IGHV4-34

基本信息
资源简介
PRJNA1371953:毛细胞白血病患者癌细胞单细胞转录组图谱
该数据集为单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,来自两名毛细胞白血病(HCL)及变异亚型(HCLv)患者,二者均表达未突变的IGHV4-34。研究对分离自外周血单个核细胞(PBMC)的CD19⁺和CD3⁺细胞进行scRNA-seq(n=2),可用于刻画人HCL细胞的表达突变与转录谱,支持探索与HCL及HCLv病理激活相关的细胞谱系和通路(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集对来自两名毛细胞白血病(HCL)及HCL变异亚型(HCLv)患者的人HCL细胞进行了分析,二者均表达未突变的IGHV4-34。对分离自外周血单个核细胞(PBMC)的CD19⁺和CD3⁺细胞进行了scRNA-seq(n=2)。该数据集可用于表征人HCL细胞的表达突变和转录谱,并支持研究与HCL及HCL变异型(HCLv)致病性激活相关的细胞谱系和通路。总体设计:本研究(方案编号10C0066)获得美国国立卫生研究院机构审查委员会(IRB)批准。从2名确诊为HCL并正在接受标准治疗的患者采集新鲜外周血。所有患者均签署了IRB批准的知情同意书,允许使用其b
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1371953
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- OpenDataLab:
数据说明
该单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集描绘了来自两名毛细胞白血病(HCL)及HCL变异亚型(HCLv)患者的人HCL细胞,两者均表达未突变的IGHV4-34。scRNA-seq是在从外周血单核细胞(PBMC)中分离出的CD19⁺和CD3⁺细胞上进行的(n=2)。此数据集有助于表征人HCL细胞的表达突变和转录谱,并支持对与导致HCL及HCL变异型(HCLv)的病理性激活相关的细胞谱系和途径的研究。总体设计:本研究(方案编号10C0066)获得了美国国立卫生研究院机构审查委员会(IRB)的批准。从两名正在接受标准治疗治疗的HCL患者中采集了新鲜外周血。所有患者均签署了IRB批准的知情同意书,允许将其血液用于研究。从外周血中纯化PBMC,并分离出CD19或CD3阳性的细胞进行全长单细胞测序。分析表达突变和转录谱,以识别单细胞的谱系和发育状态。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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