PRJNA136065：多发性骨髓瘤细胞对DZNep诱导凋亡敏感性的决定因素

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA136065

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数据说明

3-脱氮腺苷同型半胱氨酸（DZNep）是一种S-腺苷同型半胱氨酸（AdoHcy）水解酶抑制剂，在多种实体瘤和急性髓系白血病中显示出抗肿瘤活性。在此，我们研究了其对多发性骨髓瘤（MM）细胞的影响，并发现，在500 nM浓度下，它能有效抑制8种MM细胞系中2种的生长并诱导凋亡。通过Affymetrix HG-U133 Plus 2.0微阵列对未处理和DZNep处理细胞的RNA进行了分析，并通过微阵列显著性分析（SAM）测试确定了基因表达显著变化的基因。在敏感细胞中，ALOX5是最下调的基因（下调5.8倍），而在耐药细胞中表达水平较低。定量RT-PCR结果证实了这一点。Western-blot分析表明，ALOX5仅在敏感细胞系H929中高表达，并在DZNep处理后大幅减少。在H929细胞中异位表达ALOX5降低了对DZNep的敏感性。此外，通过RNA干扰下调ALOX5也能诱导H929细胞凋亡。对MM患者数据集的基因表达分析表明，与正常浆细胞相比，MM患者中ALOX5表达显著增高。

我们还发现，Bcl-2在DZNep不敏感细胞中过表达，并且DZNep与Bcl-2家族抑制剂ABT-737联合处理可协同抑制DZNep不敏感MM细胞的生长并诱导其凋亡。综上所述，本研究表明DZNep对MM疗效的机制之一与其下调ALOX5水平的能力相关。此外，DZNep不敏感可能与Bcl-2过表达有关，并且ABT-737与DZNep联合可协同诱导凋亡。这些结果提示DZNep可能对一部分MM具有治疗应用价值。总体设计：细胞用0.5 μmol/L DZNep处理48小时。使用Qiagen RNeasy Mini试剂盒（德国）提取总RNA。基因表达使用GeneChip进行。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。