基本信息

模态

基因组

任务类型

预测

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1334204：Pociredir抑制多梳抑制复合物2并在健康及镰状细胞病模型中诱导胎儿血红蛋白[数据集2]

PRJNA1334204 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的研究项目数据集，其完整英文名称为“Pociredir inhibits polycomb repressive complex 2 and induces fetal hemoglobin in healthy and sickle cell disease models [dataset 2]”。从名称可以看出，该数据集围绕 Pociredir 对 polycomb 抑制复合物 2（PRC2）的抑制作用，以及在健康模型和镰状细胞病模型中诱导胎儿血红蛋白这一研究方向展开。数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其核心数据属于转录组或基因表达层面。本站将其归类于肿瘤/白血病分类之下，并指出该数据可用于分析基因表达变化、PRC2 抑制效应以及胎儿血红蛋白诱导相关的转录特征，为相关疾病机制与潜在干预研究提供转录组层面的支持。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是一个生物学数据集合，用于汇集与某一项单一研究计划相关的各类生物数据，这些计划通常由单一机构或联合体发起。BioProject 记录为用户提供了一个统一的入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。本数据集所对应的研究计划聚焦于 Pociredir 对 PRC2 的抑制效应，以及由此引发的胎儿血红蛋白诱导现象，研究对象涵盖健康模型与镰状细胞病模型。本站将其归入肿瘤/白血病分类，提示该数据集可能与血液系统相关的病理机制研究存在关联。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。依据侧写线索，该数据可用于分析基因表达变化、PRC2 抑制效应以及胎儿血红蛋白诱导相关的转录特征。数据集名称中标注为“[dataset 2]”，表明其可能是一个更大研究项目中的第二个数据子集。关于具体的样本数量、测序平台、基因列表、表达量矩阵或差异表达分析结果等详细内容，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心。其源站标题为“Pociredir inhibits polycomb repressive complex 2 a... (ID 1334204) - BioProject - NCBI”，项目编号为 1334204。数据集英文名称中标注了 PRJNA1334204 作为其 BioProject 登录号。关于样本采集的具体方法、实验设计、处理条件、时间节点以及伦理审批等信息，源站未提供。

【适用场景】

根据本站的分类与侧写线索，该数据集适用于转录组层面的分析工作，可用于研究基因表达变化、PRC2 抑制效应以及胎儿血红蛋白诱导相关的转录特征。其潜在应用方向包括相关疾病机制探索与潜在干预研究。由于本站将其归类为肿瘤/白血病，该数据集也可能为血液系统疾病或肿瘤相关研究提供转录组层面的参考。关于具体的适用疾病类型、实验模型或临床转化场景，源站未提供更多细节。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库进行访问与检索，用户可依据项目编号 1334204 或登录号 PRJNA1334204 定位到该记录。BioProject 记录提供了查找该项目所生成各类数据的统一入口。关于数据下载方式、文件格式、分析流程或配套工具等具体使用指引，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开的生物学数据项目记录。其主题标签明确为转录组或基因表达，数据类型具有一致性。然而，关于数据质量评估指标、样本量大小、测序深度、覆盖度、重复性验证以及潜在的技术偏差等信息，源站未提供。此外，该数据集名称中标注为“[dataset 2]”，其与同一项目其他数据子集之间的关系与完整性，源站未提供。

【引用与许可】

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309132

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1334204

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

镰状细胞病（SCD）和β-地中海贫血是由血红蛋白β基因（HBB）突变引起的，这些突变导致成年血红蛋白蛋白功能异常。然而，携带额外遗传改变从而在成年期提高胎儿血红蛋白（HbF）表达的患者，其疾病严重程度会减轻。HbF适度升高即可带来临床获益，而大幅升高似乎可导致无症状疾病。阐明调控HbF表达的调控网络对于发现SCD和β-地中海贫血的新疗法至关重要。B细胞淋巴瘤/白血病11A（BCL11A）已被证明是抑制成年人胎儿血红蛋白基因（HBG1/2）表达的主调控因子。我们发现，多梳抑制复合物2（PRC2）在红系祖细胞中调控BCL11A的表达，因此是HBG1/2表达的推定上游调控因子。

此外，我们证明，通过不同的药理学或遗传学敲低方法对PRC2活性进行负向调节，可在体外和体内镰状细胞病（SCD）模型中导致BCL11A表达降低，并伴随HBG1/2 mRNA和HbF蛋白（或其直系同源物）的稳健增加。这些新发现进一步阐明了HBG1/2表达的调控网络，并对使用PRC2抑制剂作为SCD和β-地中海贫血的潜在疗法具有重要意义。抑制胚胎外胚层发育（EED），PRC2的一个关键亚基，在调节该复合物的活性方面尤为有效。这些发现的转化正在进行中，因为pociredir（FTX-6058），一种新型强效EED抑制剂，目前正在临床研究中评估作为特定血红蛋白病的潜在治疗方法（NCT05169580）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别