HDAC8抑制剂22d处理MV4-11、Kasumi-1和KG-1细胞的RNA-seq数据
该数据集为白血病细胞系MV4-11、Kasumi-1和KG-1在HDAC8抑制剂22d（10 μM）处理及对照条件下的RNA-seq数据，提供基因水平计数矩阵
基本信息
资源简介
HDAC8抑制剂22d处理MV4-11、Kasumi-1和KG-1细胞的RNA-seq数据
PRJNA1307418 数据集收录的是白血病细胞系 MV4-11、Kasumi-1 与 KG-1 在 HDAC8 抑制剂 22d（10 μM）处理及相应对照条件下的 RNA-seq 数据。测序读段经过处理后生成基因水平计数矩阵，可用于下游基因表达分析与处理组与对照组之间的比较。该数据集归属于肿瘤／白血病分类，主题标签为转录组或基因表达，来源为 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）。整体而言，它为研究 HDAC8 抑制对上述三种白血病细胞系转录组的影响提供了一份经过处理的计数数据资源。
【数据集背景】
HDAC8 属于组蛋白去乙酰化酶家族，抑制剂处理会引起细胞转录程序的改变。该数据集正是围绕 HDAC8 抑制剂 22d 在白血病细胞系中的作用而产生：对 MV4-11、Kasumi-1 和 KG-1 三种白血病细胞系，分别设置 22d 10 μM 处理组与各自的对照组，并进行 RNA 测序。其目的在于通过转录组层面的基因表达计数数据，支撑处理条件与对照条件之间的表达谱比较，为后续分析 HDAC8 抑制相关的基因表达变化提供数据基础。
【数据内容】
数据内容为上述三种白血病细胞系在 22d 处理与对照条件下的 RNA-seq 结果，经过读段处理后以基因水平计数矩阵的形式提供。计数矩阵按基因汇总，适合直接用于基因表达水平的定量比较。数据集覆盖三种细胞系与两类条件（10 μM 22d 处理、对照）的组合，主题归类为转录组或基因表达。除基因水平计数矩阵外，源站未提供其他类型数据产品的说明。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI，源站地址为 ncbi.nlm.nih.gov。实验材料为 MV4-11、Kasumi-1 与 KG-1 白血病细胞系，处理条件为 HDAC8 抑制剂 22d 10 μM，并设各自对照组。测序产生的 reads 经处理后生成基因水平计数矩阵。样本数量、测序平台、读长、重复设置等具体实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于白血病细胞系的转录组基因表达分析，尤其是比较 HDAC8 抑制剂 22d 处理组与对照组之间的基因表达差异。典型用途包括：基于基因水平计数矩阵进行差异表达分析、表达谱聚类与样本间比较，以及围绕 HDAC8 抑制所引发的转录响应开展探索性研究。由于涉及三种不同的白血病细胞系，也可用于细胞系之间表达特征的对照观察。具体分析目标需结合研究者自身设计确定。
【使用方法】
使用者可从 NCBI 获取该数据集提供的基因水平计数矩阵，并将其导入常规的转录组分析流程。一般步骤包括：读入计数矩阵并整理样本分组信息（区分 22d 10 μM 处理组与对照组，以及 MV4-11、Kasumi-1、KG-1 三种细胞系），进行表达数据的基本质控与归一化，随后开展处理组与对照组的比较分析。由于提供的是处理后计数数据而非原始读段，分析起点为基因水平计数。分析工具与参数选择源站未提供。
【质量与限制】
该数据集提供的是经过处理的基因水平计数矩阵，未包含原始测序读段，因此无法直接从原始数据重新进行比对与定量。样本重复数、测序深度、批次信息及质控指标等，源站未提供，使用时应自行评估数据适用性。数据仅涉及三种白血病细胞系在单一浓度（10 μM）22d 及对照条件下的结果，结论外推需谨慎。源站未提供其他质量评估说明。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，编号为 PRJNA1307418。具体的引用方式、作者信息与许可条款，源站未提供。使用时应遵循 NCBI 的相关数据使用政策，并建议查阅源站记录以获取最新的引用与使用要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1307418
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们对经10 μM HDAC8抑制剂22d处理的MV4-11、Kasumi-1和KG-1白血病细胞系及其各自对照组进行了RNA测序。测序读段经过处理，生成了基因水平的计数矩阵。该数据集提供了经过处理的计数数据，可用于下游基因表达分析以及处理组与对照组之间的比较。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
