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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA130357：白血病干细胞表达特征与急性髓系白血病临床结局相关

PRJNA130357 是一个以急性髓系白血病（Acute Myeloid Leukemia, AML）为研究背景的公开生物项目数据集，其英文全称为“A Leukemic Stem Cell Expression Signature is Associated with Clinical Outcomes in Acute Myeloid Leukemia”。从名称可以看出，该数据集聚焦于白血病干细胞的表达特征，并探讨这一表达特征与临床结局之间的关联。数据主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其核心数据类型属于转录组或基因表达层面。本站将其归类于肿瘤 / 白血病方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，该数据集为研究急性髓系白血病中白血病干细胞相关基因表达模式及其临床意义提供了可检索、可链接的数据资源入口。

【数据集背景】

该数据集对应 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，标题为“Homo sapiens (ID 130357) - BioProject - NCBI”。BioProject 是围绕某一项研究计划或项目而组织起来的生物数据集合，通常来源于单一机构或联合体。一个 BioProject 记录为用户提供了一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种类型数据。就本数据集而言，其研究背景落在急性髓系白血病领域，关注的是白血病干细胞的表达特征与临床结局之间的关联。急性髓系白血病是一种起源于造血系统的恶性肿瘤，白血病干细胞被认为是疾病发生、维持和复发的重要细胞群体，因此围绕其表达特征开展研究具有明确的临床与生物学意义。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容主要涉及转录组或基因表达层面的信息。

【数据内容】

该数据集的核心内容为白血病干细胞表达特征，并与临床结局相关联。其主题标签明确指向“Transcriptome or Gene expression”，意味着数据所涵盖的是基因表达或转录组相关的信息类型。数据集英文名称本身即概括了其核心命题：白血病干细胞表达特征与急性髓系白血病临床结局之间的关联。本站分类将其归入肿瘤 / 白血病方向，进一步明确了其在疾病研究中的位置。除上述信息外，关于该数据集具体包含多少样本、涉及哪些基因、采用何种表达检测平台、临床结局的具体指标等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）。其记录形式为 BioProject，标题显示为“Homo sapiens (ID 130357) - BioProject - NCBI”，物种信息为 Homo sapiens（人类）。BioProject 作为一项数据组织机制，旨在将同一研究计划下产生的多种数据类型汇聚于单一记录之下，便于用户查找和链接。该项目的具体采集方式、样本来源、实验设计、机构信息等，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与核心内容，该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是围绕急性髓系白血病中白血病干细胞表达特征的分析。研究人员可将其用于探索白血病干细胞表达模式与临床结局之间的潜在关联，也可作为肿瘤 / 白血病方向基因表达研究的参考数据资源。由于 BioProject 记录本身提供的是指向项目相关数据的链接入口，该数据集亦可用于检索和定位该项目所产生的多种数据类型。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录的形式存在于 NCBI 平台，用户可通过 NCBI 网站访问该记录，并借助 BioProject 提供的统一入口查找与该项目相关的各类数据。BioProject 的设计目的即在于为用户提供一个集中位置，以链接到同一项目下生成的不同数据类型。因此，使用该数据集时，通常先访问其 BioProject 页面，再根据页面所提供的链接进一步获取具体数据。关于数据下载、格式转换、分析流程等具体操作方式，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开的生物数据项目记录。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类为肿瘤 / 白血病。关于该数据集的质量评估指标、数据完整性、样本量、平台信息、临床结局的具体定义以及潜在偏差等，源站未提供。用户在使用时应结合源站记录中的实际信息进行判断。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录标识为 BioProject ID 130357。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制等具体信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI 及 BioProject 的相关政策与源站记录中的说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE24006

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA130357

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：在许多癌症中，特定亚群的细胞似乎具有独特的能力，能够启动和维持肿瘤生长。支持这一癌症干细胞模型的最有力证据来自免疫缺陷小鼠的移植实验，表明人类急性髓系白血病（AML）是由自我更新的白血病干细胞（LSC）驱动的细胞层级结构。这一模型对于开发新型疗法具有重要意义，但其临床意义仍不明确。目的：评估白血病干细胞表达特征与AML临床结果之间的关联。设计、环境与患者：我们基于移植实验中的功能定义，从原发性AML患者样本和异种移植中定义了LSC富集亚群的基因表达特征。利用来自四个独立队列共计1047名患者的已发表AML bulk基因表达数据，我们进行了一项回顾性队列研究，定义了LSC评分，并评估其与已知风险预测因素（包括细胞遗传学亚型和分子突变）的关联，以及作为独立预后因素的价值。

主要结局指标：白血病干细胞特征与总生存期、无事件生存期和无复发生存期之间可重复的关联。结果：LSC评分在大多数AML亚型中相似，但在急性早幼粒细胞白血病以及携带NPM1或CEBPA突变的预后良好病例中较低。引人注目的是，在这些独立队列中，高评分与较差的总生存期（OS）、无事件生存期（EFS）和无复发生存期（RFS）相关，无论是考虑核型正常的患者[OS的风险比（HR）范围为1.13-1.18，所有病例p<0.012]，还是考虑具有细胞遗传学异常的患者（OS的HR范围为1.07-1.15，所有病例p<0.01）。在多变量分析中，LSC评分与不良结局相关，且独立于年龄、FLT3或NPM1突变以及细胞遗传学风险分组，并增加了其预

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别