血液肿瘤患者造血干细胞移植后3个月骨髓单细胞转录组图谱
该数据集为血液肿瘤患者接受造血干细胞移植后3个月骨髓的单细胞转录组图谱，来源于NCBI BioProject（ID 1241856），主题标签为Transcriptome or Gene expression，本站分类归入肿瘤/白血病
基本信息
资源简介
血液肿瘤患者造血干细胞移植后3个月骨髓单细胞转录组图谱
该数据集为血液肿瘤患者接受造血干细胞移植后3个月骨髓的单细胞转录组图谱，来源于NCBI BioProject（ID 1241856），主题标签为Transcriptome or Gene expression，本站分类归入肿瘤/白血病。其英文全称为“Bone marrow single cell transcriptome profile 3 months after transplantation in blood cancer patients who received hematopoietic stem cell transplantation”。从名称可以看出，该数据集聚焦于造血干细胞移植这一血液肿瘤治疗手段之后的骨髓微环境，通过单细胞转录组技术刻画移植后特定时间点的基因表达状态，为理解移植后骨髓中各类细胞的转录特征提供数据基础。
【数据集背景】
该数据集属于肿瘤/白血病相关研究范畴，研究对象为接受造血干细胞移植的血液肿瘤患者。造血干细胞移植是血液系统恶性肿瘤治疗中的重要手段，移植后骨髓的恢复与重建过程涉及多种细胞类型和复杂的基因表达变化。该数据集选取移植后3个月这一时间点，对患者骨髓进行单细胞转录组分析，旨在从单细胞分辨率上呈现移植后骨髓的转录组图谱。源站未提供该研究的具体科学假设、研究目标或立项背景的进一步说明。
【数据内容】
该数据集的主题标签为Transcriptome or Gene expression，表明其内容属于转录组或基因表达范畴。数据集名称明确指向“骨髓单细胞转录组图谱”，说明数据以单细胞水平呈现骨髓样本的基因表达信息。源站未提供样本数量、细胞数量、测序平台、测序深度、基因覆盖情况、细胞类型注释结果或数据文件的具体格式与规模等信息。
【采集与来源】
该数据集来源于NCBI BioProject，其记录标识为ID 1241856，英文名称为“PRJNA1241856: Bone marrow single cell transcriptome profile 3 months after transplantation in blood cancer patients who received hematopoietic stem cell transplantation”。源站标题为“Bone marrow single cell transcriptome profile 3 mo... (ID 1241856) - BioProject - NCBI”，来源站为ncbi.nlm.nih.gov。BioProject作为生物数据的集合记录，用于汇集与某一项研究计划相关的多种数据类型，并提供统一的访问入口。源站未提供样本采集地点、采集时间、患者纳入标准、伦理审批信息或具体实验流程。
【适用场景】
基于该数据集的主题标签与名称，其潜在适用场景包括：血液肿瘤患者造血干细胞移植后骨髓转录组特征的分析、单细胞水平基因表达模式的探索，以及移植后3个月这一时间点骨髓细胞状态的比较研究。由于本站分类归入肿瘤/白血病，该数据集也可用于白血病及血液肿瘤相关的基础或转化研究。源站未提供该数据集在具体研究中的实际应用案例或推荐分析方向。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件组织格式、分析流程、所需软件或参考基因组版本等信息。用户如需使用，应前往NCBI BioProject记录页（ID 1241856）查看该项目的详细说明与数据获取途径。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息，包括数据完整性、测序质量、细胞过滤标准、批次效应处理或技术重复情况。同时，源站未提供该数据集的已知限制，例如样本量限制、时间点单一性带来的解释局限或人群代表性等。使用者在解读与应用该数据集时，应结合源站记录中的原始说明自行判断。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、文献出处、数据许可协议或使用条款。如需引用或使用，应查阅NCBI BioProject记录页（ID 1241856）及相关数据存档页面以获取准确的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1241856
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）后复发仍然是血液系统恶性肿瘤患者治疗失败的主要原因。为了更好地理解复发的机制，我们全面探索了骨髓T细胞在不同分化阶段抑制性受体（IRs）的表达，并检查了转录差异。在所评估的IRs中，与完全缓解（CR）患者相比，早期复发（ER）患者的CD3+ T细胞中TIM3显著上调。值得注意的是，双阴性T（DNT）细胞，一种具有MHC非依赖性细胞毒性潜力的独特亚群，在骨髓T细胞中占比较高，并且在ER患者中TIM3表达增加。此外，调节性T细胞（Tregs）显示出TIM3水平升高，促进了allo-HSCT后的免疫抑制微环境。转录分析显示，ER患者中干扰素-γ信号、氧化磷酸化和T细胞受体基因下调，表明细胞毒性功能受损。
功能实验表明，使用sabatolimab阻断TIM3可恢复T细胞细胞毒性，从而导致ER患者白血病细胞凋亡增强。这些发现凸显了TIM3作为移植后复发中免疫功能障碍的关键调节因子，并支持其作为治疗靶点的潜力。总体设计：在白血病化疗和HSCT后三个月从骨髓中采集样本，并进行Ficoll梯度分离。该数据集包括来自两名完全缓解（CR）、两名早期复发（ER）和一名晚期复发（LR）患者的scRNAseq数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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