PRJNA1065460：STING激活改善急性髓系白血病的T细胞衔接免疫治疗

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1065460

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

T细胞招募双特异性抗体（BsAbs）正在复发/难治性急性髓系白血病（AML）的临床开发中。尽管响应率令人鼓舞，但早期临床试验未能证明持久的响应。在此，我们研究了通过干扰素基因刺激因子（STING）激活先天免疫系统是否能增强靶向CD33的BsAb（CD33 BiTE®分子）对靶细胞的杀伤作用。确实，我们显示，当与STING激动剂2‘，3’-环GMP-AMP（cGAMP）联合使用时，CD33 BiTE分子AMG 330介导的对AML的细胞毒性可以大大增强。我们使用体外细胞毒性试验、免疫印迹、转录组分析和广泛的CRISPR-Cas9敲除实验来研究cGAMP对AMG330抗AML细胞毒性的增强作用。机制上，活化的T细胞通过其效应细胞因子干扰素-γ（IFNγ）和肿瘤坏死因子（TNF）使靶AML细胞对STING激活敏感，导致I型干扰素产生增加和干扰素刺激基因的诱导。

这反馈至T细胞，导致效应细胞因子进一步增加及整体细胞毒性T细胞表型的形成，从而促进了cGAMP增强AMG330介导的裂解效果。因此，我们确立了IFNγ在AMG 330介导的抗AML细胞毒性以及使AML细胞对STING激动剂响应中的关键作用。在此，我们提出通过将靶向CD33的双特异性抗体（BsAbs）与STING激动剂联合使用，以提高其疗效。总体设计：来自三名不同健康供体的HL-60细胞和人T细胞，在存在AMG 330±cGAMP的条件下共培养8小时，随后通过FACS分离并进行RNA测序。数据集展示了所有条件下（cBiTE、cBiTE+cGAMP、AMG330、AMG330+cGAMP）及每位供体T细胞的基因表达数据，涵盖去多重化、映射、过滤、标准化及跨条件方差稳定化处理后的每个映射基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。