PRJNA100863:正常核型AML中的FLT3基因表达特征

该数据集来自NCBI,包含137例正常核型急性髓系白血病(NK-AML)标本的基因表达谱,使用Stanford cDNA微阵列检测,Channel 2为Cy5标记的NK-AML RNA,Channel 1为Cy3标记的通用参考RNA

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA100863: FLT3 gene-expression signature in normal karyotype AML

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA100863:正常核型AML中的FLT3基因表达特征

该数据集来自NCBI,包含137例正常核型急性髓系白血病(NK-AML)标本的基因表达谱,使用Stanford cDNA微阵列检测,Channel 2为Cy5标记的NK-AML RNA,Channel 1为Cy3标记的通用参考RNA。研究目的是发现与FLT3-ITD突变相关的基因表达模式,并评估FLT3表达特征对预后的价值。数据可用于探索FLT3-ITD突变相关的转录组特征及预后分类研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):正常核型急性髓系白血病(NK-AML)是一个具有中等预后但分子和临床异质性显著的细胞遗传学分组。在该亚组中,FLT3(FMS样酪氨酸激酶3)内部串联重复(ITD)突变的存在预示较差结局。我们研究的目的是发现与FLT3-ITD突变相关的基因表达模式,并评估FLT3特征用于预后判断的效用。该数据集包含137例正常核型急性髓系白血病(NK-AML)标本的基因表达谱,使用Stanford cDNA微阵列完成,以配合L Bullinger等人的研究。对于每个阵列,Channel 2代表Cy5标记的NK-AML RNA,Channel 1代表Cy3标记的通用参考RNA。关键词:Logical Set 总体设计:DNA微阵列用于分析训练集中的基因表达

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA100863

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

核型正常的急性髓系白血病(NK-AML)在细胞遗传学上属于预后中等的一组,但具有显著的分子和临床异质性。在该亚组中,FLT3(FMS样酪氨酸激酶3)内部串联重复(ITD)突变的存在预示较差的结局。本研究旨在发现与FLT3-ITD突变相关的基因表达模式,并评估FLT3特征用于预后判断的效用。该数据集包含137例核型正常急性髓系白血病(NK-AML)标本的基因表达谱,采用Stanford cDNA微阵列完成,以配合L Bullinger等人的研究。对于每个微阵列,通道2代表Cy5标记的NK-AML RNA,通道1代表Cy3标记的通用参考RNA。关键词:逻辑集 总体设计:使用DNA微阵列对65例NK-AML病例的训练集进行基因表达谱分析。应用监督分析构建基于基因表达的FLT3-ITD突变状态预测器。随后通过分类来自72例NK-AML病例的独立测试集的表达谱对该预测器进行评估。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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