髓系和淋巴系白血病的谱系特异性转录组特征及治疗靶点发现
该数据集整合了超过2,600个急性和慢性白血病亚型的转录组样本,通过差异表达基因分析、功能富集和蛋白质相互作用网络研究,揭示了髓系和淋巴系白血病在DNA复制、细胞周期、转录调控及免疫信号通路方面的谱系特异性分子特征,并基于核心基因筛选出潜在治疗化合物,为白血病精准靶向治疗和药物再利用提供了重要的多模态(基因表达、临床关联)数据支持和研究方向。
https://figshare.com/articles/dataset/Lineage-specific_transcriptomic_signatures_and_therapeutic_target_discovery_in_myeloid_and_lymphoid_leukemias/30998826
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资源简介
该数据集聚焦于异质性血液恶性肿瘤——白血病,通过整合分析19个GEO数据集中的超过2,600个急性和慢性白血病亚型样本,旨在识别髓系和淋巴系白血病中的谱系特异性分子脆弱性,以指导靶向治疗和药物再利用研究。数据集包含差异表达基因(DEGs)分析结果,其中髓系白血病中鉴定出269个DEGs,淋巴系白血病中鉴定出316个DEGs,并进行了功能富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析。核心基因(如CCNB1、KIF11、EGFR、JUN)被用于通过LINCS L1000CDS2平台进行药物再利用筛选,候选化合物(如SN-38和C646)通过分子对接、动力学模拟及MTT实验在多个白血病细胞系中进行了验证。该研究揭示了髓系白血病与DNA复制和细胞周期通路相关,而淋巴系白血病则与转录调控和免疫信号通路相关,为白血病精准治疗和理性药物再利用提供了一个整合转录组学与药物发现的框架。
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