甲氨蝶呤体内反应预测急性淋巴细胞白血病结局及其独特基因表达谱

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：In Vivo Response to Methotrexate Forecasts Outcome of Acute Lymphoblastic Leukemia and Has a Distinct Gene Expression Profile
• DOI：10.1371/journal.pmed.0050083
• 发布日期：2008-04-15
• 文件数：10 个
• 文件总体积：2.23 MB
• 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/In_Vivo_Response_to_Methotrexate_Forecasts_Outcome_of_Acute_Lymphoblastic_Leukemia_and_Has_a_Distinct_Gene_Expression_Profile/153680

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文件清单

• Figure_S1.pdf（673.35 KB）
• Figure_S2.pdf（17.00 KB）
• Figure_S3.pdf（668.87 KB）
• Figure_S4.pdf（348.69 KB）
• Figure_S5.ppt（167.42 KB）
• Figure_S6.ppt（62.98 KB）
• Table_S1.doc（57.86 KB）
• Table_S2.doc（58.88 KB）
• Table_S3.doc（107.52 KB）
• Text_S1.doc（66.05 KB）

文件总体积 2.23 MB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景
儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）是儿童中最常见的癌症，目前约80%的患者可获治愈。然而，耐药是儿童ALL治疗失败的主要原因。甲氨蝶呤（MTX）广泛用于治疗多种人类癌症，全球几乎所有新诊断ALL的治疗方案均使用该药。尽管MTX已被研究多年，但对其在原发性癌细胞（包括白血病细胞）中从头耐药机制的认识相对较少。这一知识缺口部分源于现有体外方法不够可靠，无法评估原代ALL细胞对MTX的耐药性。因此，我们测定了MTX的体内抗白血病效应，并识别了在对MTX反应良好与反应不佳的患者中表达存在显著差异的基因。方法与发现
我们利用293例新诊断儿童在接受初始“ upfront”体内MTX治疗（1 g/m2）后循环白血病细胞减少的指标，以阐明患者间MTX抗白血病效应的差异。

为确定这些效应的基因组决定因素，我们对其中161名新诊断儿童（1-18岁）的原代ALL细胞进行了全基因组基因表达评估。我们鉴定出48个基因和两个cDNA克隆，其表达与初始体内MTX治疗后的循环白血病细胞减少显著相关。这一发现在一个独立的ALL儿童队列中得到了验证。此外，这种初始MTX体内反应的测量及相关的基因表达模式可预测长期无病生存（p = 0.02）。结论

总之，这些数据为MTX耐药的基因组基础及患者间MTX反应差异提供了新见解，指出了克服儿童ALL中MTX耐药的新策略。试验注册：Total XV，新诊断急性淋巴细胞白血病患者的治疗，http://www.ClinicalTrials.gov（NCT00137111）；Total XIIIBH，基于抗代谢物的III期随机研究

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pmed.0050083（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/In_Vivo_Response_to_Methotrexate_Forecasts_Outcome_of_Acute_Lymphoblastic_Leukemia_and_Has_a_Distinct_Gene_Expression_Profile/153680）。