免疫功能低下患者支气管肺泡灌洗样本联合生物标志物检测的诊断研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT01695512

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数据说明

疾病：侵袭性曲霉病、急性白血病、生物标志物、干细胞移植。在急性白血病患者及异基因造血干细胞移植后患者中，管理威胁生命的侵袭性真菌感染的主要难题在于缺乏敏感且特异的诊断工具，无法可靠且早期地识别真菌病原体。由于深度中性粒细胞减少和血小板计数低，侵入性诊断操作往往难以适时进行，因此支气管镜检查并支气管肺泡灌洗成为诊断肺部感染的首选方法，因为血液培养方法的敏感性较低，尤其是在霉菌感染中。间接方法，即所谓的替代标志物，在这一临床情境中变得越来越重要。这些血清学标志物，主要是半乳甘露聚糖（GM）以及最近的1,3-β-D-葡聚糖（BDG），已在临床试验中对血液样本进行了验证，然而，检测支气管肺泡灌洗样本的临床意义迄今为止仅基于GM的回顾性数据，而对于BDG尚未有报道。

因此，我们这项前瞻性多中心诊断研究的目的是阐明这些血清学标志物与分子工具（一种曲霉特异性PCR检测和一种多真菌PCR检测）联合应用时的敏感性和特异性，因为血清学标志物并非病原体特异性；此外，还旨在确定BAL样本中BDG的物种特异性临界值。另外，如果在临床样本中通过PCR检测到烟曲霉的基因组物质，我们将利用新型快速、灵敏、特异的非培养PCR检测和测序技术，研究真菌DNA中cyp51A基因的点突变，该突变介导对常见抗霉菌活性三唑类药物的耐药性，以尽早优化抗真菌治疗。本研究旨在改善侵袭性肺部真菌感染的早期、灵敏和特异性诊断，并检测唑类耐药模式，这可能对血液病患者的预后产生影响；因此抗真菌治疗

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。